Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03848
• Subject: XM_005263166.4
• Aligned Length: 1368
• Identities: 942
• Gaps: 426

Alignment

Query    1  ATGGATAGCCGCTTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGACAGCTCCTCGCGCAGCAGTTGGGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATAGCCGCTTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGACAGCTCCTCGCGCAGCAGTTGGGAGC  74

Query   75  TGAAAGTGCCGACAGCATTGGTGCCGTGTTAAATAGCAAAGATGAGCAGAGAGAAATTGCTGAAACAAGAGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAAAGTGCCGACAGCATTGGTGCCGTGTTAAATAGCAAAGATGAGCAGAGAGAAATTGCTGAAACAAGAGAAA  148

Query  149  CTTGCAGGGCTTCCTATGATACCTCTGCTCCAAATGCAAAACGTAAGTATCTGGATGAAGGAGAGACAGATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTGCAGGGCTTCCTATGATACCTCTGCTCCAAATGCAAAACGTAAGTATCTGGATGAAGGAGAGACAGATGAA  222

Query  223  GACAAAATGGAAGAATATAAGGATGAACTAGAAATGCAACAGGATGAAGAAAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAAAATGGAAGAATATAAGGATGAACTAGAAATGCAACAGGATGAAGAAAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT  296

Query  297  TTACAAAGATTCTAGTACTTTTCTTAAGGGAACACAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACAAAGATTCTAGTACTTTTCTTAAGGGAACACAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG  370

Query  371  TAGACACTGGACATAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATATCCTAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGACACTGGACATAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATATCCTAAA  444

Query  445  CTGAGGGAGCTCATCAGGCTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAATCTAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAGGGAGCTCATCAGGCTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAATCTAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCCGA  518

Query  519  TATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAACTAACACCCAAATTTGATGTGATTCTTCTGGAACCCCCTTTAGAAGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAACTAACACCCAAATTTGATGTGATTCTTCTGGAACCCCCTTTAGAAGAAT  592

Query  593  ATTACAGAGAAACTGGCATCACTGCTAATGAAAAATGCTGGACTTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTACAGAGAAACTGGCATCACTGCTAATGAAAAATGCTGGACTTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATTGAT  666

Query  667  GAGATTGCAGCACCTCGATCATTTATTTTTCTCTGGTGTGGTTCTGGGGAGGGGTTGGACCTTGGAAGAGTGTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGATTGCAGCACCTCGATCATTTATTTTTCTCTGGTGTGGTTCTGGGGAGGGGTTGGACCTTGGAAGAGTGTG  740

Query  741  TTTACGAAAATGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTACGAAAATGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGGAAGA  814

Query  815  CTAAGACTTTAGATCCAAAGGCTGTCTTTCAGAGAACAAAGGAACACTGCCTCATGGGGATCAAAGGAACTGTG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  815  CTAAGACTTTAGATCCAAAGGCTGTCTTTCAGAGAACAA-----------------------------------  853

Query  889  AAGCGTAGCACAGACGGGGACTTCATTCATGCTAATGTTGACATTGACTTAATTATCACAGAAGAACCTGAAAT  962
                                                                                      
Sbjct  854  --------------------------------------------------------------------------  853

Query  963  TGGCAATATAGAAAAACCTGTAGAAATTTTTCATATAATTGAGCATTTTTGTCTTGGTAGAAGACGCCTTCATC  1036
                                                                                      
Sbjct  854  --------------------------------------------------------------------------  853

Query 1037  TATTTGGAAGAGATAGTACAATTCGACCAGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAATAGCAACTACAAT  1110
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  ----------------------------AGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAATAGCAACTACAAT  899

Query 1111  GCAGAAACATATGCATCCTATTTCAGTGCTCCTAATTCCTACTTGACTGGTTGTACAGAAGAAATTGAGAGACT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  900  GCAGAAACATATGCATCCTATTTCAGTGCTCCTAATTCCTACT-------------------------------  942

Query 1185  TCGACCAAAATCGCCTCCTCCCAAATCTAAATCTGACCGAGGAGGTGGAGCTCCCAGAGGTGGAGGAAGAGGTG  1258
                                                                                      
Sbjct  943  --------------------------------------------------------------------------  942

Query 1259  GAACTTCTGCTGGCCGTGGACGAGAAAGAAATAGATCTAACTTCCGAGGAGAAAGAGGTGGCTTTAGAGGGGGC  1332
                                                                                      
Sbjct  943  --------------------------------------------------------------------------  942

Query 1333  CGTGGAGGAGCACACAGAGGTGGCTTTCCACCTCGA  1368
                                                
Sbjct  943  ------------------------------------  942