Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: NM_001195608.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 975
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888

Query  889  TCTGCGTCTTCTGAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACCAACGCAGCCACCGC  962
            ||||||||||||..||                                              .||||     ||
Sbjct  889  TCTGCGTCTTCTATGC----------------------------------------------GGCAG-----GC  911

Query  963  CACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGTCT-CAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTTAC  1035
            ||           ..||.||.|||    |||.|||  ||.| ||                   ||||  |.|||
Sbjct  912  CA-----------GAAGGCTGTCG----AACCCTT--GTATACA-------------------GAGG--TATAC  947

Query 1036  GAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAG-AC---TGT---CTCTCCAAGAGAAC-CAGCT  1101
                     ..||||    |||..|.|||        |.||| ||   |||   |||||       || ||   
Sbjct  948  ---------ATCAAG----AGCTGGTGAA--------TGCAGCACGTATGTGGGCTCTC-------ACGCA---  990

Query 1102  TCCAAAGTGACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGTAAAAATGGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGT  1175
               ||.|||.||        |||                                                   
Sbjct  991  ---AACGTGCCT--------TCT---------------------------------------------------  1002

Query 1176  AGACTTGGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
                                                 
Sbjct 1003  -------------------------------------  1002