Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: NM_133942.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 942
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||                        
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAG------------------------  198

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
                                                                                      
Sbjct  199  --------------------------------------------------------------------------  198

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
                                                          ||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  199  ----------------------------------------------GTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  226

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  227  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  300

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  301  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  374

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  375  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  448

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  522

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  523  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  596

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  597  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  670

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  671  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  744

Query  889  TCTGCGTCTTCTGAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACC---AACGCAGCCAC  959
            ||..|.||||||||||||.||..|.|.|||||||||.|||||..|.||.||||||||.||   ..|||||||||
Sbjct  745  TCATCCTCTTCTGAGCATTCCGGCTGGCCTTCAGAACCCAAATTCACTGTCCGTCCTGCCGGGGCCGCAGCCAC  818

Query  960  CGCCACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGTCTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTT  1033
            ||   |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  819  CG---CCTCACATTCCCCAGCCTCTCGCAGCCACTCTCTGGTCTCAGGCTGTGCCATGGAGAAGCGAGGAGTTT  889

Query 1034  ACGAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAAA  1107
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  890  ACCAATCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAGCCAGCTTCCAAA  963

Query 1108  GTGACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGTAAAAATGGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGTAGACTT  1181
            |||||||||||.|||.||.|.||||||||.||||||||.||||||||||.|.|||||.|.||.|.|||.|||||
Sbjct  964  GTGACTGAACAGGCTTTGCTCAGACCTCAGAGTAAAAACGGCCCTCAGGGAGAAGATGGCGAGCCAGTGGACTT  1037

Query 1182  GGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
            .||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1038  AGATGACGCCAGCCTGCCAGTCAGCGATGTG  1068