Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_006507141.3
• Aligned Length: 1321
• Identities: 995
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCAACTAAGTTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCAGAGTTTTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGAAAATACTTTCTACAAGCTAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            |.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  CTTAGTGGAGTGGGTAAATGTCTTGAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  445  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  888

Query  889  TCTGCGTCTTCT--------------------------------------------------------------  900
            ||..|.||||||                                                              
Sbjct  889  TCATCCTCTTCTGTTAACTCTAATCTTAGCTTTGCACTGTGTTCCAGATGCGGCAGGCCAGAAGGCTGTCGAAC  962

Query  901  --------------------------------------------GAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAA  930
                                                        ||||||.||..|.|.|||||||||.|||||
Sbjct  963  CCTTGTATACAGAGGTATACATCAAGAGCTGGTGAATGCAGCACGAGCATTCCGGCTGGCCTTCAGAACCCAAA  1036

Query  931  CACGCTTTCCGTCCTACC---AACGCAGCCACCGCCACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGT  1001
            ..|.||.||||||||.||   ..|||||||||||   |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1037  TTCACTGTCCGTCCTGCCGGGGCCGCAGCCACCG---CCTCACATTCCCCAGCCTCTCGCAGCCACTCTCTGGT  1107

Query 1002  CTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTTACGAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCC  1075
            ||||..||.|.|||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  CTCAGGCTGTGCCATGGAGAAGCGAGGAGTTTACCAATCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCC  1181

Query 1076  AGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAAAGTGACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGTAAAAATGGC  1149
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||                                     
Sbjct 1182  AGACTGTCTCTCCAAGAGAGCCAGCTTCCAAAGTGAC-------------------------------------  1218

Query 1150  CCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGTAGACTTGGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
                                                                           
Sbjct 1219  ---------------------------------------------------------------  1218