Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_006507145.1
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1074
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCAACTAAGTTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCAGAGTTTTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGAAAATACTTTCTACAAGCTAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            |.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  CTTAGTGGAGTGGGTAAATGTCTTGAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  445  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  888

Query  889  TCTGCGTCTTCTGAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACC---AACGCAGCCAC  959
            ||..|.||||||||||||.||..|.|.|||||||||.|||||..|.||.||||||||.||   ..|||||||||
Sbjct  889  TCATCCTCTTCTGAGCATTCCGGCTGGCCTTCAGAACCCAAATTCACTGTCCGTCCTGCCGGGGCCGCAGCCAC  962

Query  960  CGCCACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGTCTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTT  1033
            ||   |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  CG---CCTCACATTCCCCAGCCTCTCGCAGCCACTCTCTGGTCTCAGGCTGTGCCATGGAGAAGCGAGGAGTTT  1033

Query 1034  ACGAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAAA  1107
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1034  ACCAATCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAGCCAGCTTCCAAA  1107

Query 1108  GTGACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGTAAAAATGGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGTAGACTT  1181
            |||||||||||.|||.||.|.||||||||.||||||||.||||||||||.|.|||||.|.||.|.|||.|||||
Sbjct 1108  GTGACTGAACAGGCTTTGCTCAGACCTCAGAGTAAAAACGGCCCTCAGGGAGAAGATGGCGAGCCAGTGGACTT  1181

Query 1182  GGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
            .||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1182  AGATGACGCCAGCCTGCCAGTCAGCGATGTG  1212