Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_006507147.1
• Aligned Length: 1286
• Identities: 991
• Gaps: 181

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCAACTAAGTTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCAGAGTTTTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGAAAATACTTTCTACAAGCTAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            |.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  CTTAGTGGAGTGGGTAAATGTCTTGAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  445  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  888

Query  889  TCTGCGTCTTCT--------------------------------------------------------------  900
            ||..|.||||||                                                              
Sbjct  889  TCATCCTCTTCTATGCGGCAGGCCAGAAGGCTGTCGAACCCTTGTATACAGAGGTATACATCAAGAGCTGGTGA  962

Query  901  ---------GAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACC---AACGCAGCCACCGC  962
                     ||||||.||..|.|.|||||||||.|||||..|.||.||||||||.||   ..||||||||||| 
Sbjct  963  ATGCAGCACGAGCATTCCGGCTGGCCTTCAGAACCCAAATTCACTGTCCGTCCTGCCGGGGCCGCAGCCACCG-  1035

Query  963  CACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGTCTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTTACG  1036
              |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..||.|.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1036  --CCTCACATTCCCCAGCCTCTCGCAGCCACTCTCTGGTCTCAGGCTGTGCCATGGAGAAGCGAGGAGTTTACC  1107

Query 1037  AGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAAAGTG  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
Sbjct 1108  AATCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAGCCAGCTTCCAAAG--  1179

Query 1111  ACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGTAAAAATGGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGTAGACTTGGA  1184
                                                                                      
Sbjct 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179

Query 1185  CGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
                                        
Sbjct 1180  ----------------------------  1179