Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_006507149.3
• Aligned Length: 1256
• Identities: 991
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCAACTAAGTTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCAGAGTTTTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGAAAATACTTTCTACAAGCTAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            |.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  CTTAGTGGAGTGGGTAAATGTCTTGAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  445  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  888

Query  889  TCTGCGTCTTCT-----------------------------------------GAGCATCCCCCCGGTCCTTCA  921
            ||..|.||||||                                         ||||||.||..|.|.||||||
Sbjct  889  TCATCCTCTTCTATGCGGCAGGCCAGAAGGCTGTCGAACCCTTGTATACAGAGGAGCATTCCGGCTGGCCTTCA  962

Query  922  GAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACC---AACGCAGCCACCGCCACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAA  992
            |||.|||||..|.||.||||||||.||   ..|||||||||||   |||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  GAACCCAAATTCACTGTCCGTCCTGCCGGGGCCGCAGCCACCG---CCTCACATTCCCCAGCCTCTCGCAGCCA  1033

Query  993  CTCTTTGGTCTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTTACGAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACT  1066
            ||||.||||||||..||.|.|||||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CTCTCTGGTCTCAGGCTGTGCCATGGAGAAGCGAGGAGTTTACCAATCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACT  1107

Query 1067  TCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAAAGTGACTGAACAAGCTCTGTTAAGACCTCAAAGT  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||                                
Sbjct 1108  TCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAGCCAGCTTCCAAAG--------------------------------  1149

Query 1141  AAAAATGGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACCTAGTAGACTTGGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
                                                                                    
Sbjct 1150  ------------------------------------------------------------------------  1149