Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_006507152.1
• Aligned Length: 1242
• Identities: 927
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGACAGAATCGCATCTGTGGATTTCTAGACATTGAAGAAAATGAGAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            |||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCTTCGACGGTATTTCATCCTGGATACCAGAGAAGACAGCTTTGTATGGTACATGGATAATCCACAGAACCTGC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  149  CTTCAGGATCGTCACGGGTTGGAGCCATTAAACTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCAACTAAGTTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCAGAGTTTTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGAAAATACTTTCTACAAGCTAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            |.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  CTTAGTGGAGTGGGTAAATGTCTTGAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCGG  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ..||.||.|.|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  CCTCCGACAGCCTGAGTCGCCAAGGTGACTGTGGTAAGAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGACATTGTTGGTGGT  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||.|||.||||
Sbjct  445  GTGCCCATCATCACGCCGACGCAGAAAGAAGAAGTAAACGAATGTGGTGAGAGTCTGGATAGAAACAATTTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||..|||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACGGTCACAGAGCCATCTTCCTTACTTTGCTCCTAAGCCACCTTCAGACAGTGCAGTTATCAAAGCTGGGTATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGAAGCAAGGAGCGGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAGAAGGAACCTCTGCGGGTGATACCACTTAAAGAAGTGCACAAAGTCCAGGAGTGCAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAGTGACATAATGATGAGGGACAACCTGTTTGAAATCGTGACGACATCTCGGACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATCGTAGCACAGCGGGGACCTGGCAGG  888

Query  889  TCTGCGTCTTCTGAGCATCCCCCCGGTCCTTCAGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACCAACGCAGCCACCGC  962
            ||..|.|||||||                ||                                           
Sbjct  889  TCATCCTCTTCTG----------------TT-------------------------------------------  903

Query  963  CACCTCACATTCCACAGCCTCTCGCAGCAACTCTTTGGTCTCAACCTTTACCATGGAGAAGCGAGGATTTTACG  1036
                                        ||||||        ||.|||           |||      |||.| 
Sbjct  904  ----------------------------AACTCT--------AATCTT-----------AGC------TTTGC-  923

Query 1037  AGTCTCTTGCCAAG----GTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAGAGAACCAGCTTCCAA  1106
            |.|.|.||  |.||    |.||.|||||        ||||      |||||         |||||  |||    
Sbjct  924  ACTGTGTT--CCAGATGCGGCAGGCCAG--------AAGG------CTGTC---------GAACC--CTT----  966

Query 1107  AGT-GACTGA-----ACAAGCTCTGTTAAGACCT--------CA--AAGTAAAAAT---GGCCCTCAGGAAAAA  1161
             || .||.||     |||       |.||||.||        ||  |.||    ||   |||.||||.|.||| 
Sbjct  967  -GTATACAGAGGTATACA-------TCAAGAGCTGGTGAATGCAGCACGT----ATGTGGGCTCTCATGCAAA-  1027

Query 1162  GATTGTGACC----TAGTAGA---CTTGGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTGACGTG  1212
               |||| ||    |||||||   |.|||||   .||..|| |||...|||.      
Sbjct 1028  ---TGTG-CCTTCTTAGTAGAAGGCCTGGAC---TCGCTCC-TCCTTACAGC------  1071