Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03875
• Subject: XM_017016489.2
• Aligned Length: 1263
• Identities: 1026
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTATGTGGATCGTCAGAATCGCATTTGTGGTTTTCTAGACATTGAAGAAAATGAAAACAGTGGGAAATT  74

Query   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTCGAAGGTACTTCATACTGGATACCAGAGAAGATAGTTTCGTGTGGTACATGGATAATCCACAGAACCTAC  148

Query  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCTGGATCATCACGTGTTGGAGCCATTAAGCTTACCTACATTTCAAAGGTTAGCGATGCTACTAAGCTAAGG  222

Query  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAGGCGGAGTTCTGTTTTGTTATGAATGCAGGAATGAGGAAGTACTTCCTACAAGCCAATGATCAGCAGGA  296

Query  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTAGTGGAATGGGTAAATGTGTTAAACAAAGCTATAAAAATTACAGTACCAAAGCAGTCAGACTCACAGCCTA  370

Query  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTGATAACCTAAGTCGCCATGGTGAATGTGGGAAAAAGCAAGTGTCTTACAGAACTGATATTGTTGGTGGC  444

Query  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTACCCATCATTACTCCCACTCAGAAAGAAGAAGTAAATGAATGTGGTGAAAGTATTGACAGAAATAATCTGAA  518

Query  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACGGTCACAAAGCCATCTTCCTTACTTTACTCCTAAACCACCTCAAGATAGTGCGGTTATCAAAGCTGGATATT  592

Query  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTAAAACAAGGAGCAGTGATGAAAAACTGGAAGAGAAGATATTTTCAATTGGATGAAAACACAATAGGCTAC  666

Query  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAAATCTGAACTGGAAAAGGAACCTCTTCGTGTAATACCACTTAAAGAGGTTCATAAAGTCCAGGAATGTAA  740

Query  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAAAGCGACATAATGATGAGGGACAACCTCTTTGAAATTGTAACAACGTCTCGAACTTTCTATGTGCAGGCTG  814

Query  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGCCCTGAAGAGATGCACAGTTGGATTAAAGCAGTCTCTGGCGCCATTGTAGCACAGCGGGGTCCCGGCAGA  888

Query  889  TCTGCGTCTTCTGAGCATCCCCCCGGTCCTTC-AGAATCCAAACACGCTTTCCGTCCTACCAACGCAGCCACCG  961
            ||||||||||||.||               || ||.||                                    
Sbjct  889  TCTGCGTCTTCTCAG---------------TCAAGTAT------------------------------------  911

Query  962  CCACCTCACATTCCACAGCCTCTC-GCAGCAAC----TCT-TTG------------GTCTCAACCTTTACCATG  1017
                           .||.||||| |||..|||    ||| |||            ||              ||
Sbjct  912  ---------------GAGACTCTCTGCAAAAACAGTGTCTGTTGGGAAGAGGAAAAGT--------------TG  956

Query 1018  GAGAAGCGAGGATTTTACGAGTCTCTTGCCAAGGTCAAGCCAGGGAACTTCAAGGTCCAGACTGTCTCTCCAAG  1091
            ||||    |||||            .|||    |.||.|||||        ||||      |||||        
Sbjct  957  GAGA----AGGAT------------ATGC----GGCAGGCCAG--------AAGG------CTGTC--------  988

Query 1092  AGAACCAGCTTCCAAAGT-GACTGA-----ACAAGCTCTGTTAAGACCT--------CA--AAGTAAAAAT---  1146
             |||||  |||     || .||.||     |||       |.||||.||        ||  |.||    ||   
Sbjct  989  -GAACC--CTT-----GTATACAGAGGTATACA-------TCAAGAGCTGGTGAATGCAGCACGT----ATGTG  1043

Query 1147  GGCCCTCAGGAAAAAGATTGTGACC----TAGT---------AGACTTGGACGATGCGAGCCTTCCGGTCAGTG  1207
            |||.||||.|.|||.|  ||   ||    ||||         ||||||  ||.|       |||.|       .
Sbjct 1044  GGCTCTCACGCAAACG--TG---CCTTCTTAGTGGAGGGCCCAGACTT--ACTA-------CTTAC-------A  1096

Query 1208  ACGTG  1212
            ||   
Sbjct 1097  AC---  1098