Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03880
- Subject:
- NM_212452.1
- Aligned Length:
- 2278
- Identities:
- 1957
- Gaps:
- 11
Alignment
Query 1 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT 74
||||||||||||.|..|||||||||.||||||.|||.|||||||||||||..|||..||..|||.|||||||||
Sbjct 1 ATGACATCTGGTCCATTCTTCTTCTGCATCTTCATTATTGGAAAATATTTCACTCTCGGAAGTGCACAGGATGT 74
Query 75 CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG 148
||..||..||||.||||..|||||||||||||||||.|..|.||||.||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 75 CAGTTGTCCCCTCGGCTCCTTCCCCTGTGGGAACATGAGCAGGTGCCTGCCTCAGCTGCTTCACTGCAATGGTG 148
Query 149 TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA 222
||||||||||||||||.|..||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||
Sbjct 149 TGGACGACTGCGGGAACCGAGCTGATGAGGACCACTGCGGAGACAACAATGGGTGGTCTCTGCAACTGGACAAA 222
Query 223 TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATA--TCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGT 294
||||||||.|.||||||.|||.||.||| |||.|| ||| ||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.
Sbjct 223 TATTTTGCTAATTACTATAAACTGGCTT-CCACTAACTCC-TTTGAGGCAGAAACTTCCGAATGCTTGGTTGGC 294
Query 295 TCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATC 368
||||||||..||||.|||.|.||||.||.|||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 295 TCTGTGCCCATGCATTGTTTGTGCCGAGATCTAGAACTTGACTGTGATGAAGCCAATTTACGAGCTGTCCCATC 368
Query 369 GGTTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGA 442
.||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||.|||||..|..||||||.||
Sbjct 369 AGTTTCTTCCAATGTGACTGTAATGTCCCTGCAGAGGAACTTCATAAGAACACTCCCTCCCAACGGCTTCAGGA 442
Query 443 ATTATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACA-TCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGG 515
|.||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||.|||| || |||.|...|.|||.|||.||||||||
Sbjct 443 AGTACCATGAGCTGCAGAAGCTGTGCCTGCAAAACAATAGGATT-CACTCCGTGAGCGTCTCTGCCTTCAGAGG 515
Query 516 ACTGAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATC 589
||||...|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 516 ACTGCGCAGCCTCACTAAACTGTACCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTAAAGCCAGGAGTTTTTGAAGATC 589
Query 590 TTCACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTA 663
|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 590 TCCACAGACTGGAATGGCTGATAATTGAAGACAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACTCACATTTTACGGACTA 663
Query 664 AATTCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACAT 737
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 664 AATTCTCTTATTCTCTTAGTGCTGATGAATAATGCCCTCACCCGTTTGCCTGACAAACCCCTCTGTCAGCACAT 737
Query 738 GCCAAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA 811
|||..|.||.||.|||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GCCCCGCCTGCACTGGCTGGACTTTGAAGGCAACCGTATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA 811
Query 812 GTAATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAG 885
.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.||.|.|||.|||..||||||
Sbjct 812 ATAATTTAACTGTTTTGGTAATGAGGAAGAACAAAATCAATTACTTAAATGAACATGCATTTACACACCTCCAG 885
Query 886 AAACTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGA 959
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.|||||.||||||||
Sbjct 886 AAACTAGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGAACATATTTAAGGATCTGAAGGA 959
Query 960 GCTGTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAAC 1033
||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||.|||||.|||||
Sbjct 960 GCTGTCGCAATTGAATATTTCTTATAACCCAATCCAGAAAATTGAAGTAAATCAATTCGATTGTCTTGCCAAAC 1033
Query 1034 TCAAGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTC 1107
||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1034 TCAAGTCTCTCAGCCTTGAAGGAATAGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCGCTCATAAATCTC 1107
Query 1108 TCTCACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGA 1181
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1108 TCTCACATCTATTTTAAGAAATTTCAGTACTGTGGATACGCACCACATGTGCGCAGCTGTAAGCCCAACACGGA 1181
Query 1182 TGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTA 1255
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1182 TGGGATTTCATCTCTAGAGAACCTCTTGGCAAGCATCATCCAGAGAGTCTTTGTCTGGGTTGTATCTGCCATTA 1255
Query 1256 CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCA 1329
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1256 CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTTATTTGTATGCGACCATACATCAGATCTGAGAACAAGCTGCATGCCATGTCG 1329
Query 1330 ATCATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTT 1403
||||||||||||||||||||.||||||.|||||||..|.|||.||||.|||||.||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 1330 ATCATTTCTCTCTGCTGTGCTGACTGCCTAATGGGGGTGTATCTATTTGTGATTGGTGCCTTTGACCTCAAGTT 1403
Query 1404 TCGTGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCA 1477
|||.|||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||..||||||||||.|..|.||.||.|||||||
Sbjct 1404 TCGGGGAGAGTACAATAAGCACGCACAGCCGTGGATGGAGAGTGTTCATTGTCAGTTCATGGGGTCGTTGGCCA 1477
Query 1478 TTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCT 1551
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1478 TTCTGTCCACAGAAGTATCCGTTTTACTTTTAACATTTCTGACATTGGAAAAGTACATCTGCATTGTGTATCCT 1551
Query 1552 TTTAGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGT 1625
|||.|.|||.|.||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1552 TTTCGGTGTTTAAGGCCTCGAAAATGCAGAACAATCACGGTTCTGATTTTCATTTGGATTATTGGGTTTATAGT 1625
Query 1626 GGCTTTCATTCCA-TTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTT 1698
||||||...|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1626 GGCTTTTGCTCCACTTG-GCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTTCCTCTT 1698
Query 1699 CATTCAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGC 1772
|||||||||||.||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||..||
Sbjct 1699 CATTCAGAAGACACGGGAAGTACTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGTAATTTTTCTTGGTATTAACCTGGTGGC 1772
Query 1773 ATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAA 1846
||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||.||||||.|||.||||
Sbjct 1773 ATTTATCATCATTGTGTTCTCCTATGGAAGCATGTTTTACAGTGTTCATCAAAGCTCCGTAACAGTAACCGAAA 1846
Query 1847 TACGGAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGC 1920
|||.|||.|||||.||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||..|.|||
Sbjct 1847 TACAGAAGCAAGTGAAGAAGGAGGTGGTTCTCGCCAAACGCTTTTTCTTTATCGTTTTCACCGACGCGCTGTGC 1920
Query 1921 TGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGT 1994
|||||.|||||.||..||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|.||.|||||||||||
Sbjct 1921 TGGATTCCCATCTTCATACTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTGGAAATACCAGATTCTATTACCTCTTGGGT 1994
Query 1995 AGTGATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAG 2068
.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||..|||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1995 GGTGATTTTTATTCTGCCTATCAACAGTGCTTTGAACCCAATTATCTACACGTTGACCACTAGACCTTTCAAGG 2068
Query 2069 AAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAG---GTCAGAAAACATAT 2139
|||||||.||||...|.|||.|.||||||||||||||||..|||.|.|||||.|||| .||||||..|||||
Sbjct 2069 AAATGATCCATCAACTCTGGCACAACTACAGACAAAGAAGGTCTGTTGACAGGAAAGAGACTCAGAAGGCATAT 2142
Query 2140 GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTT 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|..|||.|||.||||||||.|.|..|||
Sbjct 2143 GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCCTTGCAGGAGATGTCCTCTGGGTTCATGAAGCCAGGCGCTTT 2216
Query 2214 CACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA 2271
||||.||||||||||..||||.||..|||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct 2217 CACAGACCCCTGTGATCTGTCGCTAGTTTCTCAGTCATCTAGACTCAATTCTTATTCG 2274