Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03880
• Subject: XM_006501629.2
• Aligned Length: 2278
• Identities: 1954
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT  74
            ||||||||||||.|..|||||||||.||||||.|||.|||||||||||||..|||..||..|||.|||||||||
Sbjct    1  ATGACATCTGGTCCATTCTTCTTCTGCATCTTCATTATTGGAAAATATTTCACTCTCGGAAGTGCACAGGATGT  74

Query   75  CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG  148
            ||..||..||||.||||..|||||||||||||||||.|..|.||||.||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CAGTTGTCCCCTCGGCTCCTTCCCCTGTGGGAACATGAGCAGGTGCCTGCCTCAGCTGCTTCACTGCAATGGTG  148

Query  149  TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA  222
            ||||||||||||||||.|..||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||
Sbjct  149  TGGACGACTGCGGGAACCGAGCTGATGAGGACCACTGCGGAGACAACAATGGGTGGTCTCTGCAACTGGACAAA  222

Query  223  TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATA--TCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGT  294
            ||||||||.|.||||||.|||.||.||| |||.||  ||| ||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.
Sbjct  223  TATTTTGCTAATTACTATAAACTGGCTT-CCACTAACTCC-TTTGAGGCAGAAACTTCCGAATGCTTGGTTGGC  294

Query  295  TCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATC  368
            ||||||||..||||.|||.|.||||.||.|||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  295  TCTGTGCCCATGCATTGTTTGTGCCGAGATCTAGAACTTGACTGTGATGAAGCCAATTTACGAGCTGTCCCATC  368

Query  369  GGTTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGA  442
            .||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||.|||||..|..||||||.||
Sbjct  369  AGTTTCTTCCAATGTGACTGTAATGTCCCTGCAGAGGAACTTCATAAGAACACTCCCTCCCAACGGCTTCAGGA  442

Query  443  ATTATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACA-TCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGG  515
            |.||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||.|||| || |||.|...|.|||.|||.||||||||
Sbjct  443  AGTACCATGAGCTGCAGAAGCTGTGCCTGCAAAACAATAGGATT-CACTCCGTGAGCGTCTCTGCCTTCAGAGG  515

Query  516  ACTGAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATC  589
            ||||...|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  516  ACTGCGCAGCCTCACTAAACTGTACCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTAAAGCCAGGAGTTTTTGAAGATC  589

Query  590  TTCACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTA  663
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct  590  TCCACAGACTGGAATGGCTGATAATTGAAGACAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACTCACATTTTACGGACTA  663

Query  664  AATTCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACAT  737
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  664  AATTCTCTTATTCTCTTAGTGCTGATGAATAATGCCCTCACCCGTTTGCCTGACAAACCCCTCTGTCAGCACAT  737

Query  738  GCCAAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA  811
            |||..|.||.||.|||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GCCCCGCCTGCACTGGCTGGACTTTGAAGGCAACCGTATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA  811

Query  812  GTAATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAG  885
            .|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.||.|.|||.|||..||||||
Sbjct  812  ATAATTTAACTGTTTTGGTAATGAGGAAGAACAAAATCAATTACTTAAATGAACATGCATTTACACACCTCCAG  885

Query  886  AAACTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGA  959
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  AAACTAGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGAACATATTTAAGGATCTGAAGGA  959

Query  960  GCTGTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAAC  1033
            ||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  960  GCTGTCGCAATTGAATATTTCTTATAACCCAATCCAGAAAATTGAAGTAAATCAATTCGATTGTCTTGCCAAAC  1033

Query 1034  TCAAGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTC  1107
            ||||||||||   |||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1034  TCAAGTCTCT---CCTTGAAGGAATAGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCGCTCATAAATCTC  1104

Query 1108  TCTCACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGA  1181
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1105  TCTCACATCTATTTTAAGAAATTTCAGTACTGTGGATACGCACCACATGTGCGCAGCTGTAAGCCCAACACGGA  1178

Query 1182  TGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTA  1255
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1179  TGGGATTTCATCTCTAGAGAACCTCTTGGCAAGCATCATCCAGAGAGTCTTTGTCTGGGTTGTATCTGCCATTA  1252

Query 1256  CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCA  1329
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1253  CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTTATTTGTATGCGACCATACATCAGATCTGAGAACAAGCTGCATGCCATGTCG  1326

Query 1330  ATCATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTT  1403
            ||||||||||||||||||||.||||||.|||||||..|.|||.||||.|||||.||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 1327  ATCATTTCTCTCTGCTGTGCTGACTGCCTAATGGGGGTGTATCTATTTGTGATTGGTGCCTTTGACCTCAAGTT  1400

Query 1404  TCGTGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCA  1477
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||..||||||||||.|..|.||.||.|||||||
Sbjct 1401  TCGGGGAGAGTACAATAAGCACGCACAGCCGTGGATGGAGAGTGTTCATTGTCAGTTCATGGGGTCGTTGGCCA  1474

Query 1478  TTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCT  1551
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1475  TTCTGTCCACAGAAGTATCCGTTTTACTTTTAACATTTCTGACATTGGAAAAGTACATCTGCATTGTGTATCCT  1548

Query 1552  TTTAGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGT  1625
            |||.|.|||.|.||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1549  TTTCGGTGTTTAAGGCCTCGAAAATGCAGAACAATCACGGTTCTGATTTTCATTTGGATTATTGGGTTTATAGT  1622

Query 1626  GGCTTTCATTCCA-TTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTT  1698
            ||||||...|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1623  GGCTTTTGCTCCACTTG-GCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTTCCTCTT  1695

Query 1699  CATTCAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGC  1772
            |||||||||||.||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||..||
Sbjct 1696  CATTCAGAAGACACGGGAAGTACTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGTAATTTTTCTTGGTATTAACCTGGTGGC  1769

Query 1773  ATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAA  1846
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||.||||||.|||.||||
Sbjct 1770  ATTTATCATCATTGTGTTCTCCTATGGAAGCATGTTTTACAGTGTTCATCAAAGCTCCGTAACAGTAACCGAAA  1843

Query 1847  TACGGAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGC  1920
            |||.|||.|||||.||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||..|.|||
Sbjct 1844  TACAGAAGCAAGTGAAGAAGGAGGTGGTTCTCGCCAAACGCTTTTTCTTTATCGTTTTCACCGACGCGCTGTGC  1917

Query 1921  TGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGT  1994
            |||||.|||||.||..||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|.||.|||||||||||
Sbjct 1918  TGGATTCCCATCTTCATACTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTGGAAATACCAGATTCTATTACCTCTTGGGT  1991

Query 1995  AGTGATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAG  2068
            .|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||..|||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1992  GGTGATTTTTATTCTGCCTATCAACAGTGCTTTGAACCCAATTATCTACACGTTGACCACTAGACCTTTCAAGG  2065

Query 2069  AAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAG---GTCAGAAAACATAT  2139
            |||||||.||||...|.|||.|.||||||||||||||||..|||.|.|||||.||||   .||||||..|||||
Sbjct 2066  AAATGATCCATCAACTCTGGCACAACTACAGACAAAGAAGGTCTGTTGACAGGAAAGAGACTCAGAAGGCATAT  2139

Query 2140  GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTT  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|..|||.|||.||||||||.|.|..|||
Sbjct 2140  GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCCTTGCAGGAGATGTCCTCTGGGTTCATGAAGCCAGGCGCTTT  2213

Query 2214  CACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA  2271
            ||||.||||||||||..||||.||..|||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct 2214  CACAGACCCCTGTGATCTGTCGCTAGTTTCTCAGTCATCTAGACTCAATTCTTATTCG  2271