Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03910
• Subject: XM_011514802.1
• Aligned Length: 1083
• Identities: 1039
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGACTGCGGCTCGGTCGGCGGCCAGAGGACCCAGCGCCTGCCCGGCCGCCAGCGGCTTCTCTTCTTGCCCGT  74
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Sbjct    1  ATGGACTGCGGCTCGGTCGGCGGCCAGAGGACCCAGCGCCTGCCCGGCCGCCAGCGGCTTCTCTTCTTGCCCGT  74

Query   75  GGGCCTCAGCGGAAGACCGGGCGGCAGCGAAACCTCAGCACGCCGCTGCCTCTCTGCGCTCTCCGACGGTCTGG  148
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Sbjct   75  GGGCCTCAGCGGAAGACCGGGCGGCAGCGAAACCTCAGCACGCCGCTGCCTCTCTGCGCTCTCCGACGGTCTGG  148

Query  149  GGGCGCTGCGCCCTCGCGCCCCGGCGGCCCGCGGCGGCGTGTCACGTGCCTCACCGCTGCTCCTCCTCCTGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCGCTGCGCCCTCGCGCCCCGGCGGCCCGCGGCGGCGTGTCACGTGCCTCACCGCTGCTCCTCCTCCTGCTA  222

Query  223  GTGCCCTCCCCGCGCTTGGCCGCCGCAGCCCCGCGCCGGCAGCTCGGGGACTGGGAGCGCTCGCGCCTCGGGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCCCTCCCCGCGCTTGGCCGCCGCAGCCCCGCGCCGGCAGCTCGGGGACTGGGAGCGCTCGCGCCTCGGGTA  296

Query  297  TGCCGCACCCCCGGCCGGGCGCAGCAGCGCGTGGAGGTGCTCACCGGGCGTCGCCGCTGCCGCCGGCGCCCTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCGCACCCCCGGCCGGGCGCAGCAGCGCGTGGAGGTGCTCACCGGGCGTCGCCGCTGCCGCCGGCGCCCTTC  370

Query  371  CCCAGTACCACGGCCCGGCGCCTGCACTCGTTTCCTGCAGGAGAGAGCTAAGCTTGTCTGCTGGATCCCTGCAG  444
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Sbjct  371  CCCAGTACCACGGCCCGGCGCCTGCACTCGTTTCCTGCAGGAGAGAGCTAAGCTTGTCTGCTGGATCCCTGCAG  444

Query  445  CTGGAGCGCAAAAGGAGAGATTTCACCTCTTCTGGGAGCAGGAAACTCTACTTCGACACTCATGCCTTAGTGTG  518
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Sbjct  445  CTGGAGCGCAAAAGGAGAGATTTCACCTCTTCTGGGAGCAGGAAACTCTACTTCGACACTCATGCCTTAGTGTG  518

Query  519  CTTACTGGAAGACAATGGGTTTGCTACTCAACAAGCAGAAATCATTGTGTCTGCATTGGTCAAGATCCTGGAGG  592
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Sbjct  519  CTTACTGGAAGACAATGGGTTTGCTACTCAACAAGCAGAAATCATTGTGTCTGCATTGGTCAAGATCCTGGAGG  592

Query  593  CCAACATGGACATCGTCTACAAAGATATGGTCACCAAGATGCAGCAGGAAATCACTTTTCAGCAAGTAATGTCT  666
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Sbjct  593  CCAACATGGACATCGTCTACAAAGATATGGTCACCAAGATGCAGCAGGAAATCACTTTTCAGCAAGTAATGTCT  666

Query  667  CAGATTGCGAATGTGAAAAAGGATATGATTATTTTGGAGAAGAGTGAATTTTCAGCCCTCAGAGCAGAAAATGA  740
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Sbjct  667  CAGATTGCGAATGTGAAAAAGGATATGATTATTTTGGAGAAGAGTGAATTTTCAGCCCTCAGAGCAGAAAATGA  740

Query  741  GAAAATAAAACTCGAACTACATCAGTTAAAACAACAAGTAATGGATGAAGTGATCAAAGTCCGAACAGATACCA  814
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Sbjct  741  GAAAATAAAACTCGAACTACATCAGTTAAAACAACAAGTAATGGATGAAGTGATCAAAGTCCGAACAGATACCA  814

Query  815  AATTAGACTTCAACCTAGAAAAGAGCAGAGTAAAAGAATTGTATTCATTGAACGAAAAGAAGCTGCTGGAATTG  888
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Sbjct  815  AATTAGACTTCAACCTAGAAAAGAGCAGAGTAAAAGAATTGTATTCATTGAACGAAAAGAAGCTGCTGGAATTG  888

Query  889  AGAACAGAAATAGTGGCATTGCATGCCCAGCAAGATCGGGCCCTTACCCAGACAGACAGGAAGATCGAAACTGA  962
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Sbjct  889  AGAACAGAAATAGTGGCATTGCATGCCCAGCAAGATCGGGCCCTTACCCAGACAGACAGGAAGATCGAAACTGA  962

Query  963  GGTTGCTGGCCTCAAAACCATGCTTGAGTCACACAAGCTTGATAATATTAAATATTTAGCAGGGTCTATATTTA  1036
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Sbjct  963  GGTTGCTGGCCTCAAAACCATGCTTGAGTCACACAAGCTTGATAATATTAAATATTTAGCAG-------AGAGA  1029

Query 1037  CGTGCCTA------ACAGTAGCTCTGGGATTTTATCGCCTGTGGATC  1077
            .||.||.|      ||||.| |.||                      
Sbjct 1030  AGTCCCCAGAAGAGACAGCA-CACT----------------------  1053