Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03922
• Subject: NM_022316.2
• Aligned Length: 1360
• Identities: 1173
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGCTGCCCGCGCGCTGCGCCCGCCTGCTCACGCCCCACTTGCTGCTGGTGTTGGTGCAGCTGTCCCCTGCTCG  74
            |||||||||||||   |||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|
Sbjct    1  ATGCTGCCCGCGC---GCGTCCGTCTGCTCACGCCCCACTTGCTGCTCGTGTTGGTGCAGCTGTCCCCGGCCGG  71

Query   75  CGGCCACCGCACCACAGGCCCCAGGTTTCTAATAAGTGACCGTGACCCACAGTGCAACCTCCACTGCTCCAGGA  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||..|||||..||||||
Sbjct   72  CGGCCACCGCACCACCGGCCCCAGGTTCCTAATAAGTGACCGTGACCCTCCGTGCAACCCACACTGTCCCAGGA  145

Query  149  CTCAACCCAAACCCATCTGTGCCTCTGATGGCAGGTCCTACGAGTCCATGTGTGAGTACCAGCGAGCCAAGTGC  222
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  146  CTCAGCCCAAGCCCATCTGCGCCTCTGACGGCAGGTCCTACGAGTCCATGTGTGAGTACCAGAGAGCCAAGTGC  219

Query  223  CGAGACCCGACCCTGGGCGTGGTGCATCGAGGTAGATGCAAAGATGCTGGCCAGAGCAAGTGTCGCCTGGAGCG  296
            ||||||||..||||||.||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  220  CGAGACCCAGCCCTGGCCGTGGTCCATCGAGGTCGATGCAAAGATGCTGGCCAGAGCAAGTGTCGCCTGGAGAG  293

Query  297  GGCTCAAGCCCTGGAGCAAGCCAAGAAGCCTCAGGAAGCTGTGTTTGTCCCAGAGTGTGGCGAGGATGGCTCCT  370
            ||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  294  GGCTCAGGCCTTGGAACAGGCCAAGAAGCCTCAGGAGGCTGTGTTTGTCCCAGAGTGTGGCGAGGATGGTTCCT  367

Query  371  TTACCCAGGTGCAGTGCCATACTTACACTGGGTACTGCTGGTGTGTCACCCCGGATGGGAAGCCCATCAGTGGC  444
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  368  TCACACAGGTGCAGTGCCATACGTACACAGGGTACTGCTGGTGTGTCACCCCAGATGGCAAGCCCATCAGTGGT  441

Query  445  TCTTCTGTGCAGAATAAAACTCCTGTATGTTCAGGTTCAGTCACCGACAAGCCCTTGAGCCAGGGTAACTCAGG  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  442  TCTTCCGTGCAGAATAAAACTCCTGTATGTTCAGGTCCAGTTACCGACAAGCCCTTGAGCCAGGGTAATTCAGG  515

Query  519  AAGGAAAGATGACGGGTCTAAGCCGACACCCACGATGGAGACCCAGCCGGTGTTCGATGGAGATGAAATCACAG  592
            |||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  AAGAAAAGATGATGGCTCTAAACCCACGCCCACGATGGAGACCCAACCTGTGTTCGATGGAGATGAAATCACAG  589

Query  593  CCCCAACTCTATGGATTAAACACTTGGTGATCAAGGACTCCAAACTGAACAACACCAACATAAGAAATTCAGAG  666
            ||||.||..||||||||||.||||||||.|||||.||||||||..||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct  590  CCCCCACCTTATGGATTAAGCACTTGGTAATCAAAGACTCCAAGTTGAATAACACCAACGTAAGAAATTCAGAG  663

Query  667  AAAGTCTATTCGTGTGACCAGGAGAGGCAGAGTGCCCTGGAAGAGGCCCAGCAGAATCCCCGTGAGGGTATTGT  740
            ||||||.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  664  AAAGTCCATTCCTGTGACCAGGAAAGACAGAGTGCCCTGGAAGAGGCGCGGCAGAATCCCCGAGAGGGCATTGT  737

Query  741  CATCCCTGAATGTGCCCCTGGGGGACTCTATAAGCCAGTGCAATGCCACCAGTCCACTGGCTACTGCTGGTGTG  814
            .|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  738  GATCCCCGAGTGTGCTCCTGGTGGGCTCTATAAGCCGGTGCAATGCCACCAATCCACAGGCTACTGTTGGTGCG  811

Query  815  TGCTGGTGGACACAGGGCGCCCGCTGCCTGGGACCTCCACACGCTACGTGATGCCCAGTTGTGAGAGCGACGCC  888
            |.||.||.||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  812  TCCTAGTAGACACAGGGCGCCCATTGCCGGGGACTTCCACACGCTATGTGATGCCAAGTTGCGAGAGTGACGCC  885

Query  889  AGGGCCAAGACTACAGAGGCGGATGACCCCTTCAAGGACAGGGAGCTACCAGGCTGTCCAGAAGGGAAGAAAAT  962
            ||.|||||||..|.||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  886  AGAGCCAAGAGCATAGAGGCCGATGACCCTTTCAAGGACAGGGAGTTGCCAGGTTGTCCTGAAGGGAAGAAGAT  959

Query  963  GGAGTTTATCACCAGCCTACTGGATGCTCTCACCACTGACATGGTTCAGGCCATTAACTCAGCAGCGCCCACTG  1036
            |||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GGAATTTATTACCAGCCTGCTGGATGCCCTCACCACAGACATGGTTCAGGCCATTAACTCAGCAGCGCCCACTG  1033

Query 1037  GAGGTGGGAGGTTCTCAGAGCCAGACCCCAGCCACACCCTGGAGGAGCGGGTAGTGCACTGGTATTTCAGCCAG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||||||||.|||||||||
Sbjct 1034  GAGGTGGGAGGTTCTCAGAGCCAGACCCCAGCCACACCCTGGAGGAGCGAGTGGCACACTGGTACTTCAGCCAG  1107

Query 1111  CTGGACAGCAATAGCAGCAACGACATTAACAAGCGGGAGATGAAGCCCTTCAAGCGCTACGTGAAGAAGAAAGC  1184
            |||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1108  CTGGATAGCAACAGCAGCGATGACATTAACAAGCGGGAGATGAAGCCGTTCAAGCGCTATGTAAAGAAGAAAGC  1181

Query 1185  CAAGCCCAAGAAATGTGCCCGGCGTTTCACCGACTACTGTGACCTGAACAAAGACAAGGTCATTTCACTGCCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1182  CAAGCCCAAGAAATGTGCCCGGCGCTTCACCGACTACTGCGACCTGAACAAGGATAAGGTCATCTCACTGCCTG  1255

Query 1259  AGCTGAAGGGCTGCCTGGGTGTTAGCAAAGAAGG----ACGCCTCGTC--------------------------  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||.|.|                          
Sbjct 1256  AGCTGAAGGGCTGCCTGGGTGTTAGCAAAGAAGGTGGTA-GCCTTGGCAGCTTCCCTCAGGGAAAACGAGCAGG  1328

Query 1303  ----------------------------  1302
                                        
Sbjct 1329  CACAAACCCGTTCATCGGACGCCTTGTC  1356