Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03965
- Subject:
- XM_005260806.4
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1086
- Gaps:
- 276
Alignment
Query 1 ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA 74
Query 75 AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC 148
Query 149 TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA 222
Query 223 CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT 296
Query 297 CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG 370
Query 371 TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA 444
Query 445 TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC 518
Query 519 AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG 592
Query 593 AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG 666
Query 667 GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT 740
Query 741 CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG 814
Query 815 AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCTGACCCGTGGATTGAGGACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGA 888
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCT------------------------------------------------ 840
Query 889 AGCCATAGGCAGACCCCAGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGCCTCCTCC 962
Sbjct 841 -------------------------------------------------------------------------- 840
Query 963 CATGCCTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCCCTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTT 1036
Sbjct 841 -------------------------------------------------------------------------- 840
Query 1037 TTTTCCCAGGCCAGCCCTTCCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCC 1110
Sbjct 841 -------------------------------------------------------------------------- 840
Query 1111 CACTTAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ------GGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA 908
Query 1185 TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA 982
Query 1259 GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG 1056
Query 1333 CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG 1362
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG 1086