Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04106
• Subject: NM_024621.2
• Aligned Length: 2499
• Identities: 2499
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCATCAACTGTTCAGACTGGTTTTGGGACAAAAAGATCTTTCACGAGCTGGGGACCTCTTCTCCTTAGATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATCAACTGTTCAGACTGGTTTTGGGACAAAAAGATCTTTCACGAGCTGGGGACCTCTTCTCCTTAGATGA  74

Query   75  CTCTGAGATTGAAGACAGCCTTACAGAAGCTTTGGAGCAAATTAAGATAATTAGCTCATCTTCAGATTACCAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGAGATTGAAGACAGCCTTACAGAAGCTTTGGAGCAAATTAAGATAATTAGCTCATCTTCAGATTACCAAA  148

Query  149  CCAATAACAATGACCAGGCAGTAGTTGAAATCTGTATCACAAGAATCACAACAGCCATCAGAGAGACCGAGTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAATAACAATGACCAGGCAGTAGTTGAAATCTGTATCACAAGAATCACAACAGCCATCAGAGAGACCGAGTCC  222

Query  223  ATTGAAAAGCATGCAAAGGCCCTTGTGGGGCTCTGGGACTCCTGCTTGGAACATAACCTGAGACCCTTTGGGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAAAAGCATGCAAAGGCCCTTGTGGGGCTCTGGGACTCCTGCTTGGAACATAACCTGAGACCCTTTGGGAA  296

Query  297  AGACGAAGACACTCCTCATGCAAAAATCGCATCTGATATCATGAGTTGCATTTTACAGAATTACAACCGACCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACGAAGACACTCCTCATGCAAAAATCGCATCTGATATCATGAGTTGCATTTTACAGAATTACAACCGACCCC  370

Query  371  CAGTGATGGCATTAGCCATCCCCATTGCAGTGAAATTCCTCCACAGAGGCAACAAGGAACTGTGCAGGAATATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGATGGCATTAGCCATCCCCATTGCAGTGAAATTCCTCCACAGAGGCAACAAGGAACTGTGCAGGAATATG  444

Query  445  TCTAACTACCTGTCTCTGGCTGCAATTACCAAGGCAGATCTCCTGGCTGATCACACGGAAGTTATAGTAAAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTAACTACCTGTCTCTGGCTGCAATTACCAAGGCAGATCTCCTGGCTGATCACACGGAAGTTATAGTAAAGAG  518

Query  519  CATACTCCAAGGTAACACCATGTTGTTGAGAGTGTTACCTGCTGTGTATGAAAAGCAGCCTCAGCCAATTAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATACTCCAAGGTAACACCATGTTGTTGAGAGTGTTACCTGCTGTGTATGAAAAGCAGCCTCAGCCAATTAATA  592

Query  593  GACACCTGACAGAACTCCTGGCCTTGATGTCTCAGCTGGAACAGCCAGAACAGTACCATCTACTACGGCTTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACACCTGACAGAACTCCTGGCCTTGATGTCTCAGCTGGAACAGCCAGAACAGTACCATCTACTACGGCTTTTG  666

Query  667  CATGTAGCAGCAAAGAAAAAACAACTCGAGGTAGTTCAGAAGTGTATTCCTTTCCTAATTGGGCATTTGAAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGTAGCAGCAAAGAAAAAACAACTCGAGGTAGTTCAGAAGTGTATTCCTTTCCTAATTGGGCATTTGAAGGA  740

Query  741  TTCAACCCATAATGACATCATCCTAAACATCCTCATAGAGATAGCAGTCTATGAGCCAGTGGCTTTGAACAGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCAACCCATAATGACATCATCCTAAACATCCTCATAGAGATAGCAGTCTATGAGCCAGTGGCTTTGAACAGTT  814

Query  815  TTCTTCCAATGCTGAAAGAGATTGGTGAGAGATTCCCCTACCTCACTGGACAGATGGCAAGGATTTATGGAGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCTTCCAATGCTGAAAGAGATTGGTGAGAGATTCCCCTACCTCACTGGACAGATGGCAAGGATTTATGGAGCT  888

Query  889  GTTGGGCATGTGGATGAAGAGAGAGCCAGGAGCTGCCTGACATACCTGGTGAGCCAACTGGCCAACATGGAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTGGGCATGTGGATGAAGAGAGAGCCAGGAGCTGCCTGACATACCTGGTGAGCCAACTGGCCAACATGGAGCA  962

Query  963  TTCGTTTCACCATATTCTCCTGCTGGAGATTAAAAGCATCACCGACACCTTCTCCTCAATCTTGGGCCCTCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCGTTTCACCATATTCTCCTGCTGGAGATTAAAAGCATCACCGACACCTTCTCCTCAATCTTGGGCCCTCAGA  1036

Query 1037  GCAGAGACATCTTCCGCATGAGCAACAGCTTCACCGCCATTGCTAAACTCCTTACCCGACAACTGGAAAATACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGAGACATCTTCCGCATGAGCAACAGCTTCACCGCCATTGCTAAACTCCTTACCCGACAACTGGAAAATACC  1110

Query 1111  AAGGCTGGAAGTGGCAGGAGAAAAATCAGCACTGAAATTGAATTCCCTGAGAAACTGGAAGAAACCAAGCTCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGCTGGAAGTGGCAGGAGAAAAATCAGCACTGAAATTGAATTCCCTGAGAAACTGGAAGAAACCAAGCTCAT  1184

Query 1185  AGTAACTGAAAATGAAGACCATGAAAAACTCCAAGTTAAAATCCAGGCTTTTGAAGACAAGATAAATGCAGGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTAACTGAAAATGAAGACCATGAAAAACTCCAAGTTAAAATCCAGGCTTTTGAAGACAAGATAAATGCAGGGA  1258

Query 1259  GCAATACCCCTGGCTCTATCAGAAGATATAGTCTGGGCCAAGTTTCTAAAGAAGAAAGAAAAAACATTAGATTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAATACCCCTGGCTCTATCAGAAGATATAGTCTGGGCCAAGTTTCTAAAGAAGAAAGAAAAAACATTAGATTT  1332

Query 1333  AACAGGTCAAAAAGTTTGGCTTTCCACACTATGCTCACAAAGGGTGTGGGTTCAGATGACGGCGAAGATGAAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACAGGTCAAAAAGTTTGGCTTTCCACACTATGCTCACAAAGGGTGTGGGTTCAGATGACGGCGAAGATGAAAA  1406

Query 1407  CAGGGGAGACATACCAGCCAGCATCTCTCTTTCAGAAATAGACCCACTTGGCCAAGGAAATGACAAGCTGCCGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGGGGAGACATACCAGCCAGCATCTCTCTTTCAGAAATAGACCCACTTGGCCAAGGAAATGACAAGCTGCCGT  1480

Query 1481  TTAAGACAGACACTGAGAGATCACAGCTGGGGGAGTCTTCAGTTTCATACCCAAATATTATACATATAGACTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAAGACAGACACTGAGAGATCACAGCTGGGGGAGTCTTCAGTTTCATACCCAAATATTATACATATAGACTCA  1554

Query 1555  GAGAATTTGTCAGAAACTGTTAAAGAAAACTCCCAGGAAGAAACTCCAGAGACAACTGCAAGTCCTATAGAATA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGAATTTGTCAGAAACTGTTAAAGAAAACTCCCAGGAAGAAACTCCAGAGACAACTGCAAGTCCTATAGAATA  1628

Query 1629  CCAAGATAAGCTCTACTTGCACTTAAAAAAAAACCTCAGCAAAGTGAAAGCATATGCCATGGAAATTGGAAAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAAGATAAGCTCTACTTGCACTTAAAAAAAAACCTCAGCAAAGTGAAAGCATATGCCATGGAAATTGGAAAGA  1702

Query 1703  AGATTCCAGTCCCTGATCAGTGTACCATTGAAGACACTGTGAGAAGTTGTGTAGCAAAGTTGTTCTTCACCTGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATTCCAGTCCCTGATCAGTGTACCATTGAAGACACTGTGAGAAGTTGTGTAGCAAAGTTGTTCTTCACCTGC  1776

Query 1777  TCCCTGAAGGGTCATTACTGCCTATACAGTAAGTCCAGTTTTATTCTCATCAGCCAAGAACCTCAGCCATGGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCCTGAAGGGTCATTACTGCCTATACAGTAAGTCCAGTTTTATTCTCATCAGCCAAGAACCTCAGCCATGGAT  1850

Query 1851  CCAGATCATGTTTCTATTTCAGCAGAGCCTGTTTCCTGAACCCCTGTCCATTCAGAGTCATTCTGTGCAATTCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAGATCATGTTTCTATTTCAGCAGAGCCTGTTTCCTGAACCCCTGTCCATTCAGAGTCATTCTGTGCAATTCC  1924

Query 1925  TCAGAGCTCTGTGGGAGAAGACCCAGGCAGGGGGTGCTCACAGCTTTGAAACTGCCATGATGGAGTCCACGTTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCAGAGCTCTGTGGGAGAAGACCCAGGCAGGGGGTGCTCACAGCTTTGAAACTGCCATGATGGAGTCCACGTTT  1998

Query 1999  CCACAGCAGAAGGATCTGGACCAGGTACAGCTCCATCTGGAAGAAGTGAGGTTCTTTGACGTGTTTGGCTTCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCACAGCAGAAGGATCTGGACCAGGTACAGCTCCATCTGGAAGAAGTGAGGTTCTTTGACGTGTTTGGCTTCAG  2072

Query 2073  TGAAACAGCAGGAGCATGGCAATGCTTCATGTGCAACAATCCTGAGAAAGCAACTGTTGTAAATCAAGATGGCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAAACAGCAGGAGCATGGCAATGCTTCATGTGCAACAATCCTGAGAAAGCAACTGTTGTAAATCAAGATGGCC  2146

Query 2147  AGCCTCTCATAGAAGGAAAACTTAAAGAGAAGCAAGTCAGATGGAAGTTCATCAAAAGGTGGAAAACACGCTAT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCTCTCATAGAAGGAAAACTTAAAGAGAAGCAAGTCAGATGGAAGTTCATCAAAAGGTGGAAAACACGCTAT  2220

Query 2221  TTTACACTGGCTGGAAATCAACTTCTGTTTCAAAAAGGAAAGTCTAAAGATGACCCTGACGACTGCCCAATAGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTTACACTGGCTGGAAATCAACTTCTGTTTCAAAAAGGAAAGTCTAAAGATGACCCTGACGACTGCCCAATAGA  2294

Query 2295  ACTCAGCAAAGTACAGAGTGTGAAGGCTGTGGCCAAGAAACGCAGGGACCGCTCTCTCCCCCGGGCTTTCGAAA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACTCAGCAAAGTACAGAGTGTGAAGGCTGTGGCCAAGAAACGCAGGGACCGCTCTCTCCCCCGGGCTTTCGAAA  2368

Query 2369  TCTTCACAGACAATAAAACCTATGTCTTTAAGGCCAAGGATGAGAAGAATGCAGAAGAATGGCTCCAGTGCATC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTTCACAGACAATAAAACCTATGTCTTTAAGGCCAAGGATGAGAAGAATGCAGAAGAATGGCTCCAGTGCATC  2442

Query 2443  AACGTGGCAGTTGCCCAAGCCAAAGAAAGGGAAAGTAGAGAAGTAACCACATATCTG  2499
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACGTGGCAGTTGCCCAAGCCAAAGAAAGGGAAAGTAGAGAAGTAACCACATATCTG  2499