Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04159
- Subject:
- XM_017008628.2
- Aligned Length:
- 1144
- Identities:
- 853
- Gaps:
- 278
Alignment
Query 1 ATGGAGGGGAACAGGGATGAGGCTGAGAAATGTGTCGAGATCGCCCGGGAGGCCCTGAACGCCGGCAACCGCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGGCCCAGCGCTTCCTGCAGAAGGCCGAGAAGCTCTACCCACTGCCCTCGGCCCGCGCACTATTGGAAATAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTATGAAAAATGGAAGCACGGCTGGAAATAGCCCTCATTGCCGAAAACCATCAGGTAGTGGCGATCAAAGCAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTAATTGCACAAAGGACAGCACATCTGGTAGTGGTGAAGGTGGAAAAGGCT-------ATACCAAAGACCAAG 289
|.|.|||.|||.|| ||||
Sbjct 1 --------------------------------------ATGGGGAGAAGTCTTGCAATAATAC----------- 25
Query 290 TAGATGGAGTTCTCAGCATAAACAAATGTAAAAATTACTATGAAGTACTTGGAGTTACGAAAGATGCTGGTGAT 363
|..||..|.|.|..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 TGCATCCATTGCATAACATAAACAAATGTAAAAATTACTATGAAGTACTTGGAGTTACGAAAGATGCTGGTGAT 99
Query 364 GAAGATTTGAAAAAAGCTTATAGAAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCATGCACCTGGAGCAAC 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 GAAGATTTGAAAAAAGCTTATAGAAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCATGCACCTGGAGCAAC 173
Query 438 AGATGCTTTTAAAAAGATTGGAAATGCTTATGCTGTTTTAAGTAATCCAGAAAAGCGAAAACAGTATGACCTCA 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 AGATGCTTTTAAAAAGATTGGAAATGCTTATGCTGTTTTAAGTAATCCAGAAAAGCGAAAACAGTATGACCTCA 247
Query 512 CGGGCAATGAAGAACAAGCATGTAACCACCAAAACAATGGCAGATTTAATTTCCATAGAGGTTGTGAAGCTGAT 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 CGGGCAATGAAGAACAAGCATGTAACCACCAAAACAATGGCAGATTTAATTTCCATAGAGGTTGTGAAGCTGAT 321
Query 586 ATAACTCCAGAAGACTTGTTTAATATATTTTTTGGGGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCTTTTTCAAA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 ATAACTCCAGAAGACTTGTTTAATATATTTTTTGGGGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCTTTTTCAAA 395
Query 660 TGGAAGAGCTGGTTATAGCCAACAACATCAGCATCGACATAGTGGACATGAAAGAGAAGAGGAAAGAGGAGATG 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 TGGAAGAGCTGGTTATAGCCAACAACATCAGCATCGACATAGTGGACATGAAAGAGAAGAGGAAAGAGGAGATG 469
Query 734 GAGGTTTTTCTGTGTTTATCCAGCTGATGCCCATAATTGTATTGATCCTCGTGTCATTATTAAGCCAGTTGATG 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 GAGGTTTTTCTGTGTTTATCCAGCTGATGCCCATAATTGTATTGATCCTCGTGTCATTATTAAGCCAGTTGATG 543
Query 808 GTCTCTAATCCTCCTTATTCCTTATATCCCAGATCTGGAACTGGGCAAACTATTAAAATGCAAACAGAAAACTT 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 GTCTCTAATCCTCCTTATTCCTTATATCCCAGATCTGGAACTGGGCAAACTATTAAAATGCAAACAGAAAACTT 617
Query 882 GGGTGTTGTTTATTATGTCAACAAGGACTTCAAAAATGAATATAAAGGAATGTTATTACAAAAGGTAGAAAAGA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 GGGTGTTGTTTATTATGTCAACAAGGACTTCAAAAATGAATATAAAGGAATGTTATTACAAAAGGTAGAAAAGA 691
Query 956 GTGTGGAGGAAGATTATGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAACAAAAAACAGATATGCAG 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 GTGTGGAGGAAGATTATGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAACAAAAAACAGATATGCAG 765
Query 1030 TATGCAGCAAAAGTATACCGTGATGATCGACTCCGAAGGAAGGCAGATGCCTTGAGCATGGACAACTGTAAAGA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 TATGCAGCAAAAGTATACCGTGATGATCGACTCCGAAGGAAGGCAGATGCCTTGAGCATGGACAACTGTAAAGA 839
Query 1104 ATTAGAGCGGCTTACCAGTCTTTATAAAGGAGGA 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ATTAGAGCGGCTTACCAGTCTTTATAAAGGAGGA 873