Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04170
- Subject:
- XM_005260835.3
- Aligned Length:
- 1095
- Identities:
- 837
- Gaps:
- 258
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCGAAATCATTTTTTCCATGGTTTGGACTGGATATCGGTGGAACTCTGGTCAAGCTGGTATATTTTGAACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAAAGACATCACTGCTGAAGAAGAAGAGGAAGAAGTGGAAAGTCTTAAAAGCATTCGGAAGTACCTGACCTCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGTGGCTTATGGGTCTACAGGCATTCGGGACGTGCACCTCGAGCTGAAGGACCTGACTCTGTGTGGACGCAAA 222
Query 1 ------------------------------------ATGCCTGCTTTTATTCAAATGGGCAGAGATAAAAACTT 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCAATCTGCACTTTATACGCTTTCCCACTCATGACATGCCTGCTTTTATTCAAATGGGCAGAGATAAAAACTT 296
Query 39 CTCGAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGGTGGAGCGTACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAG 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCGAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGGTGGAGCGTACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAG 370
Query 113 GTGATCTTCAGCTTTGCAAACTGGATGAACTAGATTGCTTGATCAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTCGGA 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGATCTTCAGCTTTGCAAACTGGATGAACTAGATTGCTTGATCAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTCGGA 444
Query 187 TTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTACTTTGAAAACCCTGCTGATTCTGAAAAGTGTCAGAAGTTACCATTTGA 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTACTTTGAAAACCCTGCTGATTCTGAAAAGTGTCAGAAGTTACCATTTGA 518
Query 261 TTTGAAAAATCCGTATCCTCTGCTTCTGGTGAACATTGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTATATTCCAAAG 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTGAAAAATCCGTATCCTCTGCTTCTGGTGAACATTGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTATATTCCAAAG 592
Query 335 ATAATTACAAACGGGTCACAGGTACTAGTCTTGGAGGAGGAACTTTTTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGC 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATAATTACAAACGGGTCACAGGTACTAGTCTTGGAGGAGGAACTTTTTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGC 666
Query 409 TGTACCACTTTTGAAGAAGCTCTTGAAATGGCATCTCGTGGAGATAGCACCAAAGTGGATAAACTAGTACGAGA 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTACCACTTTTGAAGAAGCTCTTGAAATGGCATCTCGTGGAGATAGCACCAAAGTGGATAAACTAGTACGAGA 740
Query 483 TATTTATGGAGGGGACTATGAGAGGTTTGGACTGCCAGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGCTTTGGAAACATGATGA 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATTTATGGAGGGGACTATGAGAGGTTTGGACTGCCAGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGCTTTGGAAACATGATGA 814
Query 557 GCAAGGAGAAGCGAGAGGCTGTCAGTAAAGAGGACCTGGCCAGAGCGACTTTGATCACCATCACCAACAACATT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAAGGAGAAGCGAGAGGCTGTCAGTAAAGAGGACCTGGCCAGAGCGACTTTGATCACCATCACCAACAACATT 888
Query 631 GGCTCAATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAACATTAACCAGGTGGTATTTGTTGGAAATTTCTTGAGAAT 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTCAATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAACATTAACCAGGTGGTATTTGTTGGAAATTTCTTGAGAAT 962
Query 705 TAATACGATCGCCATGCGGCTTTTGGCATATGCTTTGGATTATTGGTCCAAGGGGCAGTTGAAAGCACTTTTTT 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAATACGATCGCCATGCGGCTTTTGGCATATGCTTTGGATTATTGGTCCAAGGGGCAGTTGAAAGCACTTTTTT 1036
Query 779 CGGAACACGAGGGTTATTTTGGAGCTGTTGGAGCACTCCTTGAGCTGTTGAAGATCCCG 837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGGAACACGAGGGTTATTTTGGAGCTGTTGGAGCACTCCTTGAGCTGTTGAAGATCCCG 1095