Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04228
• Subject: XM_006529809.3
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1018
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGGACCTCTTCGGGG---ACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAA  71
            |||   ||.||.|..|   |||            |.||.|        .|.|.|    ||||.|||||.|||..
Sbjct    1  ATG---CTTTTTGAAGATAACC------------ACCGTT--------ACAGTT----GGAAGGAAGCACAGGG  47

Query   72  AGGACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTG  145
            |.|||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct   48  ACGACCCGTGCTCTTTGAGGACCTGCCCCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGCTCTGGGGGACCTTTACTCTTTG  121

Query  146  ATGATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAA  219
            |||||||.||.||.|||..|||||||.|||||||||||||||||||||||...||||||.||||.|||||||||
Sbjct  122  ATGATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAGGTTCCCAGGTGGTGAAGACTGAA  195

Query  220  GGGAAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTG  293
            |||||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  GGGAAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTG  269

Query  294  TAAAGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  TAAAGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGG  343

Query  368  ATGCCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATAT  441
            |||||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  344  ATGCCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATAC  417

Query  442  TTTGCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAAT  515
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  418  TTTGCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAAT  491

Query  516  CAGAAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGC  589
            |||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.||||
Sbjct  492  CAGGAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGC  565

Query  590  ATACTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGT  663
            |.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  566  ACACCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGT  639

Query  664  GTTCTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGA  737
            ||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  640  GTCCTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGA  713

Query  738  GGAGAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGA  811
            |||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  714  GGAAAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGA  787

Query  812  TACAGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGAC  885
            |||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.
Sbjct  788  TACAGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGAT  861

Query  886  GGGCAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTT  959
            |||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GGGCAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTT  935

Query  960  CATTTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTC  1033
            |||||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  936  CATTTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCC  1009

Query 1034  TCGAGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCAACAGG  1107
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|..||.||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1010  TTGAGGATGACAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGCCTGCTGTTGATGCCCGCTATGAAGCTGCATGCAACAGG  1083

Query 1108  CTGGCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC  1176
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1084  CTGGCCAACAAGGCAGTGCAGCGGGGCTCAGCAGACAACGTGACGGTGATGGTGGTGAGGATAGGACAC  1152