Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04233
- Subject:
- XM_011510020.2
- Aligned Length:
- 1726
- Identities:
- 1685
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGTTG----CTCTTATTC---AGTGTAATCC----TAATCTCATGGGTAT--------CCACTGTTGGGGGAG 55
|||.|| ||.|.|..| ||.| ||.|| .|||.| |||.| ||| ||| |.||
Sbjct 1 ATGGTGAAGCCTTTGAGACAGAAGAG-AAACCAGGAGAATGT----GGTGTTCCATAGACCA-TGT----GAAG 64
Query 56 AAGGAACACTTTGTGATTTTCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCC 129
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 CAGGAACACTTTGTGATTTTCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCC 138
Query 130 CAAGTTCCTACAGGGGAAGTTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGAC 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 CAAGTTCCTACAGGGGAAGTTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGAC 212
Query 204 TCGCATAACATGCACAGAAGAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGA 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 TCGCATAACATGCACAGAAGAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGA 286
Query 278 AAAATGGTCATTCTGAATCTTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 AAAATGGTCATTCTGAATCTTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGA 360
Query 352 TACAGCCTTCAAAACAATGAGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTT 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TACAGCCTTCAAAACAATGAGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTT 434
Query 426 CACTAAAGGAGAATGTCATGTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 CACTAAAGGAGAATGTCATGTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAG 508
Query 500 TTGGAGACGTGTTGAAATTCTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAA 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 TTGGAGACGTGTTGAAATTCTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAA 582
Query 574 TTTGGGTGGTCACCTAACTTTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 TTTGGGTGGTCACCTAACTTTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAA 656
Query 648 TGGTGAAGTTAAGGAGATAAGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATT 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TGGTGAAGTTAAGGAGATAAGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATT 730
Query 722 TTATAATAAACGGGCCTAAGAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAA 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 TTATAATAAACGGGCCTAAGAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAA 804
Query 796 GTGAAAACATGTGGATACATACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGG 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GTGAAAACATGTGGATACATACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGG 878
Query 870 AGTTTCAGTCGAGGTGAATTGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 AGTTTCAGTCGAGGTGAATTGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAA 952
Query 944 TATGGACAGAGCTTCCTATGTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAA 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TATGGACAGAGCTTCCTATGTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAA 1026
Query 1018 ACATTACTCAAGCTATCTGGGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAG 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 ACATTACTCAAGCTATCTGGGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAG 1100
Query 1092 ATACAGGCACTCAGTCTGTATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCT 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 ATACAGGCACTCAGTCTGTATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCT 1174
Query 1166 GCCCACCGCCACCTCAGATACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTA 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 GCCCACCGCCACCTCAGATACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTA 1248
Query 1240 GCTGTTCTCTGTAAAGAAAACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATC 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 GCTGTTCTCTGTAAAGAAAACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATC 1322
Query 1314 ATTACCACGCTGTGTTGAGTCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCAT 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 ATTACCACGCTGTGTTGAGTCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCAT 1396
Query 1388 TCCCATTATCAGTATATCCTCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCT 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 TCCCATTATCAGTATATCCTCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCT 1470
Query 1462 GTAACTGTAACATGCAGAAATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGA 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 GTAACTGTAACATGCAGAAATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGA 1544
Query 1536 AAACATGAACAAAAATAACATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTG 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 AAACATGAACAAAAATAACATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTG 1618
Query 1610 TTGAATTCCAGTGTAAATTCCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGG 1683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TTGAATTCCAGTGTAAATTCCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGG 1692
Query 1684 AAATTTGAATATCCTATATGTGAA 1707
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 AAATTTGAATATCCTATATGTGAA 1716