Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04249
• Subject: NM_001258367.2
• Aligned Length: 1147
• Identities: 844
• Gaps: 298

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MERHQPRLHHPAQGSAAGTPYPSSASLRGCRESKMPRRKGPQHPPPPSGPEEPGEKRPKFLDKFASIRIPGSKK  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ERPPLPNLKTAFASSDCSAAPLEMMENFPKPLSENELLELFEKMMGSLKRSRQISPQEFIHELKMGSADERLVT  148

Query    1  ---------------------------------------------------------------------MSEER  5
                                                                                 |||||
Sbjct  149  CLESLRVSLTSNPVSWVESFGHEGLGLLLDILEKLISGKIQEKVVKKNQHKVIQCLKALMNTQYGLERIMSEER  222

Query    6  SLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVCIVGEESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNSVQLQVACM  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  SLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVCIVGEESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNSVQLQVACM  296

Query   80  QLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDE  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  QLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDE  370

Query  154  AYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLT  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLT  444

Query  228  QFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKKEAKINELQAELQAFKSQFGALPADCNIPLPP  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  QFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKKEAKINELQAELQAFKSQFGALPADCNIPLPP  518

Query  302  SKEGGTGHSALPPPPPLPSGGGVPPPPPPPPPPPLPGMRMPFSGPVPPPPPLGFLGGQNSPPLPILPFGLKPKK  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SKEGGTGHSALPPPPPLPSGGGVPPPPPPPPPPPLPGMRMPFSGPVPPPPPLGFLGGQNSPPLPILPFGLKPKK  592

Query  376  EFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWIKVNENKYENVDLLCKLENTFCCQQKERREEEDIEEKKSIKKKIKEL  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  EFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWIKVNENKYENVDLLCKLENTFCCQQKERREEEDIEEKKSIKKKIKEL  666

Query  450  KFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQF  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  KFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQF  740

Query  524  VVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTF  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  VVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTF  814

Query  598  GFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEICEEKYPDILNFVDDLEPLDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEK  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEICEEKYPDILNFVDDLEPLDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEK  888

Query  672  ELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKEQYETLSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTF  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKEQYETLSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTF  962

Query  746  MQAIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRT  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  MQAIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRT  1036

Query  820  PMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHGNKPYL--------------------------------------------  849
            ||||||||||||||||||||||||.|....                                            
Sbjct 1037  PMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHENQKVQLTEGSRSHYNINCNSTRTPVAKELNYNLDTHTSTGRIKAAEKKE  1110

Query  850  -------------------------------------  849
                                                 
Sbjct 1111  ACNVESNRKKETELLGSFSKNESVPEVEALLARLRAL  1147