Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04249
• Subject: NM_019670.1
• Aligned Length: 1172
• Identities: 724
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MERHRARALGRDSKSSRRKGLQSAPPAGPYEPGEKRPKLHLNIRTLTDDMLDKFASIRIPGSKKERPPLPHLKT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  VSGISDSSSLSSETMENNPKALPESEVLKLFEKMMEDMNLNEDKKAPLREKDFGIKKEMVMQYINTASKTGSLR  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  SSRQISPQEFLHELKMGYTDERLFTYLESLRVSLTSHPVSWVQSFGHEGLGLLLDILEKLINGQIQEKVVKKTQ  222

Query    1  --------------------MSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVCIVGEESILEEVLEALTSAGEE  54
                                ||..|||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  HKVIQCLRALMNTQYGLERIMSDKRSLSLLAKAMDPRQPAMMADVVKLLSAVCIVGEESILEEVLEALTSAGEE  296

Query   55  KKIDRFFCIVEGLRHNSVQLQVACMQLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKV  128
            .||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  RKIDRFFSIVEGLRHNSVNLQVACMQLINALVTSPDDLDFRLHLRNEFMRCGLKEILPNLKGIKNDGLDIQLKV  370

Query  129  FDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDEAYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQYFKLIDECV  202
            |||||||||.|..|||||||||||||.|||.|.|.|||||||||.|.||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct  371  FDEHKEEDLSEFFHRLEDIRAELDEASDVYSMLWDTVKETRAEGHFLSILQHLLLIRNDRFIREQYFKLIDECV  444

Query  203  SQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKKEAKINE  276
            |||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||||||..||||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct  445  SQIVLHRDGTDPDFTYRKRLDLDLSQFVDVCIDQAKLDEWEEKASEHCKKFEKECTDHQETQAQLQKREAKINE  518

Query  277  LQAELQAFKSQFGALPADCNIPLPPSKEGGTGHSALPPPPPLPSGG-GVPPPPPPPPPPPLPGMRMPFSGPVPP  349
            ||||||||||||||||....|||.||.||..|.|||||.||..||| ..|||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  519  LQAELQAFKSQFGALPPGTKIPLQPSVEGEAGPSALPPAPPALSGGVPPPPPPPPPPPPPLPGMPMPFGGPVPP  592

Query  350  PPPLGFLGGQNSPPLPILPFGLKPKKEFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWIKVNENKYENVDLLCKLENTF  423
            ||||||||||.|.||. |||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  593  PPPLGFLGGQSSIPLN-LPFGLKPKKEFKPEISMRRLNWLKIGPNEMSENCFWIKVNENKYENRDLLCKLENTF  665

Query  424  CCQQKERREEEDIEEKKSIKKKIKELKFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKH  497
            |||.||.|...|..|||.|||..|||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||.|.||||||||||
Sbjct  666  CCQEKEKRNTNDFDEKKVIKKRMKELKFLDPKIAQNLSIFLSSFRVPYEKIRTMILEVDETQLSESMIQNLIKH  739

Query  498  LPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQFVVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSK  571
            |||.|||.|||||.|.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  LPDEEQLKSLSQFRSDYNSLCEPEQFAVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSK  813

Query  572  SFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEICEEKYPDILNFVDDLEPLD  645
            .|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..||||..|||.|||||..||
Sbjct  814  GFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFDLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVDVCEEKHADILHFVDDLAHLD  887

Query  646  KASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEKELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKEQYETLSKLHENMEKLYQSII  719
            |||.||||.||||..|||||||||||.|||||||||||||||.|||.|||||.||||.||.|...|..|||||.
Sbjct  888  KASRVSVEMLEKNVKQMGRQLQQLEKNLETFPPPEDLHDKFVIKMSSFVISANEQYEKLSTLLGSMTQLYQSIM  961

Query  720  GYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEG  793
            ||||.|.||||||.|..|||||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  962  GYYAVDMKKVSVEEFFNDLNNFRTSFMLALKENIKKREAAEKEKRARIAKERAEKERLERQQEKKRLLEMKTEG  1035

Query  794  DETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRTPMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHGNKPYL------------------  849
            |||||||.|||||||||||||||||||..||.||||||||||||||||||.|....                  
Sbjct 1036  DETGVMDSLLEALQSGAAFRDRRKRTPKLKDIRQSLSPMSQRPVLKVCNHENQKMQLTEGSRPHHSINCNSTRT  1109

Query  850  --------------------------------------------------------------  849
                                                                          
Sbjct 1110  PVAKELNYNLDTHASTGRIKAVEKEACNAESNKKKEMELLGSVAKSESVPEVEALLARLRAL  1171