Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04294
Subject:
XM_011244551.2
Aligned Length:
664
Identities:
465
Gaps:
131

Alignment

Query   1  ATGGAAGAAGATGAGTTCATTGGAGAAAAAACATTCCAACGTTATTGTGCAGAATTCATTAAACATTCACAACA  74
           |||   ||.|||||||||.||||||||||||..|||||.|.||||||||||||||||||.|.|||||||||.||
Sbjct   1  ATG---GAGGATGAGTTCTTTGGAGAAAAAAGCTTCCAGCATTATTGTGCAGAATTCATCAGACATTCACAGCA  71

Query  75  GATAGGTGATAGTTGGGAATGGAGACCATCAAAGGACTGTTCTGATGGCTACATGTGCAAAATACACTTTCAAA  148
           ||||||.|||.|.||||||||||||                                                 
Sbjct  72  GATAGGCGATGGCTGGGAATGGAGA-------------------------------------------------  96

Query 149  TTAAGAATGGGTCTGTGATGTCACATCTAGGAGCATCTACCCATGGACAGACATGTCTTCCCATGGAGGAGGCT  222
                                                         ||||.||             |||||..|
Sbjct  97  ----------------------------------------------ACAGCCA-------------AGGAGAAT  111

Query 223  TTCGAGCTACCCTTGGATGATTGTGAAGTGATTGA-AACTGCAGCAGCGTCCGAAGTGATTAAATATGAGTATC  295
           ||.||||||||..|||||||||.|||||||| .|| |.|||||||.|.|.|.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 112  TTAGAGCTACCAATGGATGATTCTGAAGTGA-CGAGACCTGCAGCGGTGGCAGAAGTGATTAAACATGAGTATC  184

Query 296  ATGTCTTATATTCCTGTAGCTACCAAGTGCCTGTACTTTACTTTAGGGCAAGCTTTTTAGATGGGAGACCTTTA  369
           ||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 185  ATGTCTTATACTCTTGTAGTTACCAAGTGCCGGTTCTTTACTTTAGGGCAAGCTTTTTAGATGGGAGACCGTTA  258

Query 370  ACTCTGAAGGACATATGGGAAGGAGTTCATGAGTGCTATAAGATGCGACTGCTACAGGGACCATGGGACACTAT  443
           .|||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||..|.|.|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 259  GCTCTGGAGGATATATGGGAAGGTGTTCATGAGTGCTATAAGCCGAGGCTGCTCCAGGGACCGTGGGATACCAT  332

Query 444  TACGCAACAGGAACATCCAATACTTGGGCAACCCTTTTTTGTACTTCATCCCTGCAAGACGAATGAATTCATGA  517
           .||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 333  CACCCAGCAGGAACATCCAATACTTGGGCAACCATTTTTTGTTCTACATCCCTGCAAGACAAATGAATTCATGA  406

Query 518  CTCCTGTATTAAAGAATTCTCAGAAAATCAATAAGAATGTCAACTATATCACATCATGGCTGAGCATTGTAGGG  591
           ||.||||..||||||||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||
Sbjct 407  CTGCTGTGCTAAAGAATTCACAGAAAATCAATAGAAATGTCAACTATATCACATCATGGCTGAGCCTCGTGGGG  480

Query 592  CCAGTTGTTGGGCTGAATCTACCTCTGAGTTATGCCAAAGCAACGTCTCA---GGATGAACGAAATGTCCCT  660
           |||||.|||||.||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||   |||.               
Sbjct 481  CCAGTGGTTGGTCTGAATTTACCTCTGAGCTATGCTAAAGCAACATCACAATCGGAG---------------  537