Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04322
Subject:
NM_029826.2
Aligned Length:
778
Identities:
673
Gaps:
2

Alignment

Query   1  ATGGCAGCATGCCGTGCATTAAAAGCTGTTTTGGTAGATCTCAGTGGCACACTTCACATTGAAGATGCAGCTGT  74
           ||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCAGCGCGCCGTGCGTTAAAAGCTGTTTTGGTGGATCTCAATGGCACACTTCACATTGAAGATGCAGCTGT  74

Query  75  GCCAGGCGCACAGGAAGCTCTTAAAAGGTTACGTGGTGCTTCTGTAATCATTAGGTTTGTGACCAATACAACCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||...|||||||.||..||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GCCAGGCGCACAGGAAGCTCTTAAAAGGTTGCGTGCCACTTCTGTGATGGTTCGGTTTGTGACCAATACAACCA  148

Query 149  AAGAGAGCAAGCAAGACCTGTTAGAAAGGTTGAGAAAATTGGAATTTGATATCTCTGAAGATGAAATATTCACA  222
           |||||||||||.|||||||..|.||.||..|||.||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 149  AAGAGAGCAAGAAAGACCTACTGGAGAGACTGAAAAAACTGGAGTTTGAGATCTCCGAAGATGAAATATTTACT  222

Query 223  TCTCTGACTGCAGCCAGAAGTTTACTAGAGCGGAAACAAGTCAGACCCATGCTGCTAGTTGATGATCGGGCACT  296
           ||.|||||.||||||.|||..|||.|.||||.|||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 223  TCCCTGACAGCAGCCCGAAACTTAATCGAGCAGAAGCAAGTCAGGCCCATGCTCCTGGTTGATGACCGCGCACT  296

Query 297  ACCTGATTTCAAAGGAATACAAA-CAAGTGATCCTAATGCTGTGGTCATGGGATTGGCACCAGAACATTTTCAT  369
           .|||||.||||.||||.|.|||| |.|| ||.||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 297  GCCTGAGTTCACAGGAGTTCAAACCCAG-GACCCCAACGCTGTGGTCATTGGACTGGCACCAGAGCATTTTCAT  369

Query 370  TATCAAATTCTGAATCAAGCATTCCGGTTACTCCTGGATGGAGCACCTCTGATAGCAATCCACAAAGCCAGGTA  443
           |||||..|||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 370  TATCAGCTTCTGAACCAAGCATTCCGGCTACTCCTGGATGGAGCCCCTCTGATAGCTATCCACAAGGCCAGGTA  443

Query 444  TTACAAGAGGAAAGATGGCTTAGCCCTGGGGCCTGGACCATTTGTGACTGCTTTAGAGTATGCCACAGATACCA  517
           .||||||||.|||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 444  CTACAAGAGAAAAGATGGCTTAGCCTTGGGACCAGGACCATTTGTGACTGCCTTAGAGTATGCCACAGACACGA  517

Query 518  AAGCCACAGTCGTGGGGAAACCAGAGAAGACGTTCTTTTTGGAAGCATTGCGGGGCACTGGCTGTGAACCTGAG  591
           ||||||..||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||.|||...|||.|||||.|||.|||
Sbjct 518  AAGCCATGGTGGTGGGGAAACCAGAGAAGACATTCTTTCTGGAAGCCTTGAGGGATGCTGACTGTGCACCGGAG  591

Query 592  GAGGCTGTCATGATAGGAGATGATTGCAGGGATGATGTTGGTGGGGCTCAAGATGTCGGCATGCTGGGCATCTT  665
           |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||..|..|.|||||||||||||||||
Sbjct 592  GAGGCCGTCATGATAGGAGACGATTGCAGGGATGATGTCGATGGGGCTCAGAACATTGGCATGCTGGGCATCTT  665

Query 666  AGTAAAGACTGGGAAATATCGAGCATCAGATGAAGAAAAAATTAATCCACCTCCTTACTTAACTTGTGAGAGTT  739
           |||.||.||.||||||||...||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 666  AGTTAAAACCGGGAAATACAAAGCAGCAGATGAAGAAAAAATTAATCCACCTCCCTACTTAACTTGCGAGAGCT  739

Query 740  TCCCTCATGCTGTGGACCACATTCTGCAGCACCTATTG  777
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 740  TCCCTCACGCTGTGGACCACATTCTGCAGCACCTCCTG  777