Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04403
- Subject:
- XM_006496842.3
- Aligned Length:
- 1089
- Identities:
- 849
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ------ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAA 68
|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGACCATGGAGAAAAGTGGGAACATACAATTGGAGATCCCCGACTTCAGCAACTCTGTTCTGAGCCATCTCAA 74
Query 69 CCAGTTGCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG 142
||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCTACGAATGCAAGGCCGGCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG 148
Query 143 TGGTGCTGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCA 216
|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 149 TAGTACTGGCTGCCAGCTCCCCTTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAAATGAGTACTGTGTCCATTTCT 222
Query 217 GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGC 290
||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAGCAACTTCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTAGC 296
Query 291 AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCC 364
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCTAGTTTTCTGCAGATGCAGCATATTATAGACAAATGTACGCAGATCC 370
Query 365 TGGAGGGCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA 438
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGAGGGCATTCACTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA 444
Query 439 GAGAGACCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAA 512
||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||.||||
Sbjct 445 GAGAGACCTCCAGAGTCTCATAGGGCTACACCAAATCTAAACCGCTCACTTAGTCCACGGCATAATGCCTCAAA 518
Query 513 GGGAAACCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCC 586
|||||||.||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct 519 GGGAAACTGGAGAGGGCAGGTCAGTGCCGTGCTGGATATCCGAGAGCTCAGTCCCCCGGAGGAGCCCACCAGTC 592
Query 587 CTCAGATCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGG 660
|||||||.|||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 593 CTCAGATAATTGAACAGAGTTCTGATGCAGAAGGCCGGGAGCCCATTCTTCGAATCAACAGAGCAGGACAGTGG 666
Query 661 TATGTGGAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACAT 734
||||||||.||||||.|.||.||||..||||..|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 TATGTGGAAACAGGACTAGCAGACCAGGGGGCCCGGAGTGGTGACGAAGTTAGGGTTCTTGGAGCAGTGCACAT 740
Query 735 CAAAACTGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG 808
|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAACTGAAAATCTAGAAGAGTGGCTTGGGCCAGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG 814
Query 809 AAGTAACAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCA 882
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGTCACAGCCATGGTGATTGACACCACAGGCCATGGTTCTATAGGACAGGAAAGTTATACTTTAGGGTCTTCA 888
Query 883 GGAGCCAAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGAC 956
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 889 GGAGCCAAGGTAGCTCGGCCAACCAGCAGTGAAGTTGACAGG-------------------------------- 930
Query 957 AGAGAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTATGGA 1030
Sbjct 931 -------------------------------------------------------------------------- 930
Query 1031 GTTGTGGATTTAGAACTGCTTTGGTGGTTGGAGGAATTGCTACTGTGTATGAA 1083
Sbjct 931 ----------------------------------------------------- 930