Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04403
- Subject:
- XM_011238813.1
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 990
- Gaps:
- 435
Alignment
Query 1 ------ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAA 68
|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGACCATGGAGAAAAGTGGGAACATACAATTGGAGATCCCCGACTTCAGCAACTCTGTTCTGAGCCATCTCAA 74
Query 69 CCAGTTGCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG 142
||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCTACGAATGCAAGGCCGGCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG 148
Query 143 TGGTGCTGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCA 216
|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 149 TAGTACTGGCTGCCAGCTCCCCTTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAAATGAGTACTGTGTCCATTTCT 222
Query 217 GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGC 290
||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAGCAACTTCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTAGC 296
Query 291 AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCC 364
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCTAGTTTTCTGCAGATGCAGCATATTATAGACAAATGTACGCAGATCC 370
Query 365 TGGAGGGCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA 438
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGAGGGCATTCACTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA 444
Query 439 GAGAGACCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAA 512
||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||.||||
Sbjct 445 GAGAGACCTCCAGAGTCTCATAGGGCTACACCAAATCTAAACCGCTCACTTAGTCCACGGCATAATGCCTCAAA 518
Query 513 GGGAAACCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCC 586
|||||||.||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct 519 GGGAAACTGGAGAGGGCAGGTCAGTGCCGTGCTGGATATCCGAGAGCTCAGTCCCCCGGAGGAGCCCACCAGTC 592
Query 587 CTCAGATCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGG 660
|||||||.|||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 593 CTCAGATAATTGAACAGAGTTCTGATGCAGAAGGCCGGGAGCCCATTCTTCGAATCAACAGAGCAGGACAGTGG 666
Query 661 TATGTGGAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACAT 734
||||||||.||||||.|.||.||||..||||..|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 TATGTGGAAACAGGACTAGCAGACCAGGGGGCCCGGAGTGGTGACGAAGTTAGGGTTCTTGGAGCAGTGCACAT 740
Query 735 CAAAACTGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG 808
|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAACTGAAAATCTAGAAGAGTGGCTTGGGCCAGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG 814
Query 809 AAGTAACAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCA 882
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGTCACAGCCATGGTGATTGACACCACAGGCCATGGTTCTATAGGACAGGAAAGTTATACTTTAGGGTCTTCA 888
Query 883 GGAGCCAAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGAC 956
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 889 GGAGCCAAGGTAGCTCGGCCAACCAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGTCCCTCCGGCAGTGTTGTTTCCATGAC 962
Query 957 AGAGAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTA---- 1026
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 963 AGAAAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACTTAGCTCCCAGGTAGAAG 1036
Query 1027 -------------TGGAGT---------TGTGGATT------------TAGAACTGCTTT------GGTGGTT- 1059
.||||| ||||||.| .||||.|| | |.|||||
Sbjct 1037 AGTCAGCAATGATGGGAGTAAGCGCCTATGTGGAGTATCTCCGAGAACAAGAAGTG---TCCGAACGATGGTTC 1107
Query 1060 -GGAGGAAT------------TG---CTACTGTG-------TATGAA--------------------------- 1083
||...||| || |||||||| |.|.||
Sbjct 1108 CGGTATAATCCCCGTCTCACCTGCATCTACTGTGCCAAATCTTTCAACCAAAAGGGAAGTCTGGACCGCCACAT 1181
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1182 GCGCCTGCATATGGGAATCACACCGTTTGTCTGCCGCATGTGTGGAAAAAAGTATACCCGGAAAGACCAGCTGG 1255
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1256 AATATCACATCCGCAAGCACACAGGCAACAAGCCCTTTCACTGTCACGTTTGTGGCAAAAGTTTCCCCTTCCAG 1329
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1330 GCCATCTTGAATCAGCACTTTCGAAAAAACCACCCTGGTTGTATACCCCTGGAAGGGCCTCATAGCATTTCTCC 1403
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1404 TGAGACTACTGTCACTTCCCGGCAAGCTGAAGAAGGGTCACCTTCACACGAAGAAATAGTTGCTCCTGGAGAAT 1477
Query 1084 ----------------------------------- 1083
Sbjct 1478 CTGCCCAGGGCTCAGTTTCTACTACTGGGCCAGAT 1512