Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04403
- Subject:
- XM_024450302.1
- Aligned Length:
- 1527
- Identities:
- 1059
- Gaps:
- 462
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAACCAGTT 74
Query 75 GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAGTGGTGC 148
Query 149 TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCAGTCATC 222
Query 223 AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGCAGATAT 296
Query 297 CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCCTGGAGG 370
Query 371 GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAAGAGAGA 444
Query 445 CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAAGGGAAA 518
Query 519 CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCCCTCAGA 592
Query 593 TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGGTATGTG 666
Query 667 GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACATCAAAAC 740
Query 741 TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGGAAGTAA 814
Query 815 CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCAGGAGCC 888
Query 889 AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGACAGAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGACAGAGAG 962
Query 963 ACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTATG--GAGTTG 1034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 963 ACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTA-GAAGAGT-- 1033
Query 1035 TGGATTTAGAACTGCTTTGGTGGTTGGAGGAA-TTGCTACTGT---GTAT------------GAA--------- 1083
|.||..||.|| ||||.|| |.|||| ||| |||| |||
Sbjct 1034 -----------CAGCAATGATG---GGAGTAAGTGGCTA-TGTGGAGTATCTCCGAGAGCAGGAAGTATCTGAG 1092
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1093 CGGTGGTTCCGGTACAACCCTCGTCTCACCTGCATCTATTGCGCCAAATCTTTCAACCAGAAGGGAAGCCTGGA 1166
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1167 CCGCCACATGCGCCTACACATGGGGATCACACCATTCGTCTGCCGCATGTGTGGCAAGAAGTATACCCGGAAAG 1240
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1241 ATCAGCTGGAGTATCATATCCGCAAGCACACAGGCAACAAGCCCTTTCACTGTCATGTCTGTGGCAAAAGTTTC 1314
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1315 CCCTTCCAGGCCATCTTGAATCAGCACTTTCGCAAAAACCACCCTGGCTGTATACCCCTGGAGGGGCCTCACAG 1388
Query 1084 -------------------------------------------------------------------------- 1083
Sbjct 1389 CATCTCCCCTGAAACAACTGTCACATCTCGAGGACAAGCTGAGGAAGAGTCACCTTCACAGGAAGAGACAGTTG 1462
Query 1084 ----------------------------------------------- 1083
Sbjct 1463 CTCCTGGGGAAGCTGTCCAGGGCTCTGTGTCCACCACTGGGCCAGAC 1509