Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_04448
Subject:
XM_017021712.1
Aligned Length:
649
Identities:
436
Gaps:
209

Alignment

Query   1  ATGACTTATGCTTATCTCTTCAAGTATATCATCATCGGAGACACAGGTGTGGGGAAGTCATGTCTCCTCCTGCA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTTTACAGATAAGCGGTTCCAGCCTGTCCACGACCTCACAATAGGTGTGGAGTTTGGAGCTCGTATGGTCAACA  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  TTGATGGAAAACAAATCAAACTGCAAATCTGGGATACGGCTGGGCAAGAATCCTTCCGTT-CTATCACCCGTTC  221
                                       .||||| ||     .|.||||         || .|||         
Sbjct   1  ----------------------------ATGGGA-AC-----AGAAAGA---------TTAATAT---------  22

Query 222  CTACTACAGGGGAGCAGCTGGAGCACTGCTGGTGTACGACATTACAAGGCGTGAAACCTTCAACCACCTGACCT  295
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  23  --------GGGGAGCAGCTGGAGCACTGCTGGTGTACGACATTACAAGGCGTGAAACCTTCAACCACCTGACCT  88

Query 296  CATGGTTAGAGGATGCCCGGCAGCACTCTAGTTCCAACATGGTTATCATGCTCATTGGGAATAAGAGTGACCTA  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  89  CATGGTTAGAGGATGCCCGGCAGCACTCTAGTTCCAACATGGTTATCATGCTCATTGGGAATAAGAGTGACCTA  162

Query 370  GAGTCCCGCAGGGATGTGAAGAGAGAAGAAGGAGAGGCCTTTGCTAGGGAGCATGGACTTATATTCATGGAAAC  443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163  GAGTCCCGCAGGGATGTGAAGAGAGAAGAAGGAGAGGCCTTTGCTAGGGAGCATGGACTTATATTCATGGAAAC  236

Query 444  TTCAGCCAAAACAGCCTGCAATGTTGAAGAGGCCTTCATTAACACAGCCAAAGAAATATATAGGAAGATCCAGC  517
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237  TTCAGCCAAAACAGCCTGCAATGTTGAAGAGGCCTTCATTAACACAGCCAAAGAAATATATAGGAAGATCCAGC  310

Query 518  AGGGTTTATTTGATGTCCACAATGAGGCAAATGGCATCAAGATTGGGCCCCAACAGTCAATTTCAACATCAGTG  591
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311  AGGGTTTATTTGATGTCCACAATGAGGCAAATGGCATCAAGATTGGGCCCCAACAGTCAATTTCAACATCAGTG  384

Query 592  GGACCCAGTGCCTCCCAGCGGAACTCTCGTGACATAGGGTCCAACTCTGGCTGCTGC  648
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385  GGACCCAGTGCCTCCCAGCGGAACTCTCGTGACATAGGGTCCAACTCTGGCTGCTGC  441