Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04457
• Subject: NM_001098798.2
• Aligned Length: 1545
• Identities: 1311
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAGCAGACTCGCACAGAGGCTGTCGCGGGCGCGTTCTCTCGCTGCCTGGGCTTCTGTGGAATGAGACTCGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCTCCTTCTACTTGCAAGACACTGGTGCATTGCAGGTGTGTTTCCGCAGAAGTTTGATGGTGACAGTGCCTACG  148

Query    1  -----ATGAGTGACGGAAACCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAA  69
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGGATGAGTGACGGAAACCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAA  222

Query   70  GACTATGAGATCCCCCCGATAACACCTCCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGC  143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTATGAGATCCCCCCGATAACACCTCCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGC  296

Query  144  CAGCTACCACTCGCTGTGCCACGGCCTCACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACC  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCTACCACTCGCTGTGCCACGGCCTCACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACC  370

Query  218  TCCCAGCCATCATGGTGTCCAACATGCTAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAG  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCCAGCCATCATGGTGTCCAACATGCTAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAG  444

Query  292  GAGATGGTCCACTCGGAAGTGGCTGCCTATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGATGGTCCACTCGGAAGTGGCTGCCTATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCT  518

Query  366  GGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACA  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACA  592

Query  440  GCTCCCCATCACCGCCGGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAA  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCCCCATCACCGCCGGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAA  666

Query  514  GTGCATTTCAAGATCTCGGGAGAAAAGAGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAA  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGCATTTCAAGATCTCGGGAGAAAAGAGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAA  740

Query  588  GAAAAAGAAGGACCCCAATGAGCCGCAGAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCG  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAAAGAAGGACCCCAATGAGCCGCAGAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCG  814

Query  662  CCATCAAGGGTCAGAACCCCAGTGCCACTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTG  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATCAAGGGTCAGAACCCCAGTGCCACTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTG  888

Query  736  GGAGAGGAACAGAAGCAGGCCTACAAGAGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAGGCCCTGGCAGC  809
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  889  GGAGAGGAACAGAAGC----------------------------------------------------------  904

Query  810  CTACCGGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAGCTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAG  883
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  -----------------------AGAGCTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAG  955

Query  884  CCAAAATGCTCCCACCCAAGCAGCCCATGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTG  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CCAAAATGCTCCCACCCAAGCAGCCCATGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTG  1029

Query  958  CAGGCCTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCTGCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCT  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  CAGGCCTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCTGCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCT  1103

Query 1032  CAGTGCGTCCCCGCCGCCGCCACCCTCCTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTC  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CAGTGCGTCCCCGCCGCCGCCACCCTCCTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTC  1177

Query 1106  ACGCCCAGGGCGCCCTCCTCAGTCCACCTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCC  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  ACGCCCAGGGCGCCCTCCTCAGTCCACCTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCC  1251

Query 1180  ATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTT  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  ATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTT  1325

Query 1254  CCCCAGCAGCTCGGGATCCTGCTCACCTGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACC  1327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  CCCCAGCAGCTCGGGATCCTGCTCACCTGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACC  1399

Query 1328  CCAGTGGGGAGTGTGGCATCAGCACCTGCAGCCTGCTCCCCAGGGACAAATCGCTCTACCTCACC  1392
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  CCAGTGGGGAGTGTGGCATCAGCACCTGCAGCCTGCTCCCCAGGGACAAATCGCTCTACCTCACC  1464