Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04457
- Subject:
- XM_006499613.3
- Aligned Length:
- 1516
- Identities:
- 1227
- Gaps:
- 131
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCTTGAGGTGTGTGTGTTGGGAGGCAGGGAACTATTCTAAGACCCATGTAAGGCAAAAGTTTGATGGTGA 74
Query 1 ----------------ATGAGTGACGGAAACCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCG 58
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|||
Sbjct 75 CAGTGCCTACGTGGGGATGAGTGACGGAAATCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTATAACAGCCAGGGCG 148
Query 59 AGAACAACGAAGACTATGAGATCCCCCCGATAACACCTCCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGG 132
|||..|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGTAACGAAGACTATGAGATTCCTCCTATAACGCCTCCCAATCTCCCTGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGG 222
Query 133 GACCACGAAGCCAGCTACCACTCGCTGTGCCACGGCCTCACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCA 206
||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223 GATCACGAAGCCGGCTACCACTCGCTGTGTCACGGCCTTGCGCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCGTACCA 296
Query 207 GGCCATGGACCTCCCAGCCATCATGGTGTCCAACATGCTAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGC 280
.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AGCAATGGATCTCCCTGCCATCATGGTGTCCAACATGCTGGCCCAGGACGGCCATCTGCTGTCAGGCCAGCTGC 370
Query 281 CCACGATCCAGGAGATGGTCCACTCGGAAGTGGCTGCCTATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGC 354
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 CCACGATCCAGGAAATGGTCCACTCGGAGGTGGCGGCATATGACTCAGGCCGGCCAGGGCCCCTGCTGGGCCGC 444
Query 355 CCGGCAATGCTGGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAG 428
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..|
Sbjct 445 CCGGCGATGCTGGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCTCAGCTCATCTCCCAGATGGGTATCCGGAGTGG 518
Query 429 CATCGCCCACAGCTCCCCATCACCGCCGGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAG 502
|||.||.|||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 519 CATTGCTCACGGCTCCCCATCACCTCCAGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCATCCAGTTCCACACAGGAGG 592
Query 503 AGGAGTCGGAAGTGCATTTCAAGATCTCGGGAGAAAAGAGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAAC 576
||||.||.||.|..||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AGGAATCAGATGCCCATTTCAAGATCTCGGGAGAGAAGAGACCCTCAGTGGACCCAGGCAAAAAGGCCAAGAAT 666
Query 577 CCGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACCCCAATGAGCCGCAGAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGA 650
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 CCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGGACCCCAATGAGCCACAGAAGCCAGTGTCGGCCTACGCTCTCTTCTTCAGAGA 740
Query 651 CACTCAGGCCGCCATCAAGGGTCAGAACCCCAGTGCCACTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGT 724
|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 741 CACTCAGGCTGCCATCAAGGGGCAGAATCCCAGTGCCACCTTTGGAGATGTGTCCAAAATAGTGGCGTCCATGT 814
Query 725 GGGACAGCCTGGGAGAGGAACAGAAGCAGGCCTACAAGAGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAG 798
||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 815 GGGACAGCCTGGGAGAAGAGCAGAAACAGGCGTATAAGAGGAAGACTGAAGCTGCCAAGAAGGAGTACCTGAAA 888
Query 799 GCCCTGGCAGCCTACCGGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAGCTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGC 872
|||.||||.||||||.|.|||||||||||.|||||||||.||||.||.|||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 889 GCCTTGGCGGCCTACAGAGCTAGCCTCGTGTCCAAGAGCCCCCCGGACCAAGGTGAGGCCAAGAACACTCAGGC 962
Query 873 AAACCCACCAGCCAAAATGCTCCCACCCAAGCAGCCCATGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGC 946
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 AAACCCACCAGCCAAAATGCTTCCACCCAAGCAGCCCATGTACGCCATGCCCGGCCTGGCTTCCTTCCTGACGC 1036
Query 947 CGTCGGACCTGCAGGCCTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCTGCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTG 1020
|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1037 CCTCCGACCTGCAGGCCTTCCGCAGTGGAGCCTCTCCCGCCAGCCTTGCCAGGACGCTGGGCTCCAAGGCCCTG 1110
Query 1021 CTGCCAGGCCTCAGTGCGTCCCCGCCGCCGCCACCCTCCTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTC 1094
|||||.||||||||..|.| |||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1111 CTGCCGGGCCTCAGCACAT---CGCCGCCACCACCCTCCTTCCCTCTCAGCCCCTCACTGCACCAGCAGCTGCC 1181
Query 1095 ACTGCCCCCTCACGCCCAGGGCGCCCTCCTCAGTCCACCTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCC 1168
|||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1182 ACTGCCCCCCCACGCGCAGGGCACTCTCCTCAGCCCGCCTCTCAGCATGTCCCCAGCCCCGCAGCCTCCTGTCC 1255
Query 1169 TGCCCACCCCCATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCAC 1242
||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1256 TGCCTGCCTCCATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCACAC 1329
Query 1243 ATCTCTGAGTTCCCCAGCAGCTCGGGATCCTGCTCACCTGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGA 1316
||||||||.|||.||||..||||.||.|||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||
Sbjct 1330 ATCTCTGATTTCTCCAGTGGCTCTGGCTCCCGCTCACCTGGCCCATCCAACCCTTCCAGCAGCGGAGACTGGGA 1403
Query 1317 CAGCAGCTACCCCAGTGGGGAGTGTGGCATCAGCACCTGCAGCCTGCTCCCCAGGGA-CAAATCGCTCTACCTC 1389
..|.||.|||||||||||||||.|||||.||.||||||||||.|| ||.|..|||.| |..|.||| |.|| |
Sbjct 1404 TGGGAGTTACCCCAGTGGGGAGCGTGGCCTCGGCACCTGCAGACT-CTGCAGAGGCAGCCCACCGC-CCAC--C 1473
Query 1390 ACC--------------------------------- 1392
|||
Sbjct 1474 ACCAGCCCAAAGAACCTGCAGGAACCTTCTGCCCGC 1509