Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04457
• Subject: XM_006499614.3
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1227
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGAGTGACGGAAACCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAAGACTA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||||||..|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGACGGAAATCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTATAACAGCCAGGGCGAGAGTAACGAAGACTA  74

Query   75  TGAGATCCCCCCGATAACACCTCCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGCCAGCT  148
            ||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct   75  TGAGATTCCTCCTATAACGCCTCCCAATCTCCCTGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGATCACGAAGCCGGCT  148

Query  149  ACCACTCGCTGTGCCACGGCCTCACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACCTCCCA  222
            |||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct  149  ACCACTCGCTGTGTCACGGCCTTGCGCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCGTACCAAGCAATGGATCTCCCT  222

Query  223  GCCATCATGGTGTCCAACATGCTAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAGAT  296
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCCATCATGGTGTCCAACATGCTGGCCCAGGACGGCCATCTGCTGTCAGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAAAT  296

Query  297  GGTCCACTCGGAAGTGGCTGCCTATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCTGGCCA  370
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGTCCACTCGGAGGTGGCGGCATATGACTCAGGCCGGCCAGGGCCCCTGCTGGGCCGCCCGGCGATGCTGGCCA  370

Query  371  GCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACAGCTCC  444
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.||.|||.|||||
Sbjct  371  GCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCTCAGCTCATCTCCCAGATGGGTATCCGGAGTGGCATTGCTCACGGCTCC  444

Query  445  CCATCACCGCCGGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAAGTGCA  518
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|..||
Sbjct  445  CCATCACCTCCAGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCATCCAGTTCCACACAGGAGGAGGAATCAGATGCCCA  518

Query  519  TTTCAAGATCTCGGGAGAAAAGAGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAAGAAAA  592
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  519  TTTCAAGATCTCGGGAGAGAAGAGACCCTCAGTGGACCCAGGCAAAAAGGCCAAGAATCCAAAGAAGAAGAAGA  592

Query  593  AGAAGGACCCCAATGAGCCGCAGAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCGCCATC  666
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  AGAAGGACCCCAATGAGCCACAGAAGCCAGTGTCGGCCTACGCTCTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCTGCCATC  666

Query  667  AAGGGTCAGAACCCCAGTGCCACTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGA  740
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGCAGAATCCCAGTGCCACCTTTGGAGATGTGTCCAAAATAGTGGCGTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGA  740

Query  741  GGAACAGAAGCAGGCCTACAAGAGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAGGCCCTGGCAGCCTACC  814
            .||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||.||||||.
Sbjct  741  AGAGCAGAAACAGGCGTATAAGAGGAAGACTGAAGCTGCCAAGAAGGAGTACCTGAAAGCCTTGGCGGCCTACA  814

Query  815  GGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAGCTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAA  888
            |.|||||||||||.|||||||||.||||.||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCTAGCCTCGTGTCCAAGAGCCCCCCGGACCAAGGTGAGGCCAAGAACACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAA  888

Query  889  ATGCTCCCACCCAAGCAGCCCATGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTGCAGGC  962
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  ATGCTTCCACCCAAGCAGCCCATGTACGCCATGCCCGGCCTGGCTTCCTTCCTGACGCCCTCCGACCTGCAGGC  962

Query  963  CTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCTGCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCTCAGTG  1036
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||..
Sbjct  963  CTTCCGCAGTGGAGCCTCTCCCGCCAGCCTTGCCAGGACGCTGGGCTCCAAGGCCCTGCTGCCGGGCCTCAGCA  1036

Query 1037  CGTCCCCGCCGCCGCCACCCTCCTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTCACGCC  1110
            |.|   |||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1037  CAT---CGCCGCCACCACCCTCCTTCCCTCTCAGCCCCTCACTGCACCAGCAGCTGCCACTGCCCCCCCACGCG  1107

Query 1111  CAGGGCGCCCTCCTCAGTCCACCTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCCATGGC  1184
            ||||||.|.||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||.|||||||
Sbjct 1108  CAGGGCACTCTCCTCAGCCCGCCTCTCAGCATGTCCCCAGCCCCGCAGCCTCCTGTCCTGCCTGCCTCCATGGC  1181

Query 1185  ACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTTCCCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||
Sbjct 1182  ACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCACACATCTCTGATTTCTCCA  1255

Query 1259  GCAGCTCGGGATCCTGCTCACCTGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACCCCAGT  1332
            |..||||.||.|||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||..|.||.|||||||||
Sbjct 1256  GTGGCTCTGGCTCCCGCTCACCTGGCCCATCCAACCCTTCCAGCAGCGGAGACTGGGATGGGAGTTACCCCAGT  1329

Query 1333  GGGGAGTGTGGCATCAGCACCTGCAGCCTGCTCCCCAGGGA-CAAATCGCTCTACCTCACC-------------  1392
            ||||||.|||||.||.||||||||||.|| ||.|..|||.| |..|.||| |.||  ||||             
Sbjct 1330  GGGGAGCGTGGCCTCGGCACCTGCAGACT-CTGCAGAGGCAGCCCACCGC-CCAC--CACCAGCCCAAAGAACC  1399

Query 1393  --------------------  1392
                                
Sbjct 1400  TGCAGGAACCTTCTGCCCGC  1419