Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04460
- Subject:
- XM_011239469.2
- Aligned Length:
- 1798
- Identities:
- 1333
- Gaps:
- 356
Alignment
Query 1 ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC 296
|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC 29
Query 297 AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG 370
.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 30 CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG 103
Query 371 GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 444
||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 177
Query 445 GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA 517
||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 178 GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA 250
Query 518 GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA 591
.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 251 AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA 324
Query 592 AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT 665
||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 325 AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT 398
Query 666 GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAA------------- 726
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGTATCCTGTTTG 472
Query 727 -------------------------------------------------------------------------- 726
Sbjct 473 CCTCTTTTACTGCAGCCATTCACTGGGCTGGTGGCTTCAAGGATTTTTCTACAATAACCCCTAAGCCCCTTTCC 546
Query 727 TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 547 TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAA 620
Query 801 AATTATTCTTACATATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAG 874
.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 621 GATTATTCTCACATATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAG 694
Query 875 CCTTCTACAAGCTGGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGG 948
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 695 CCTTCTACAAGCTGGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGG 768
Query 949 TTCCGATACAGTGGCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAAT 1022
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 769 TTCCGATACAGTGGCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAAT 842
Query 1023 ACACAGAGCAGGGATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCA 1096
||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 843 ACACAGAGCAGGGATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCA 916
Query 1097 GGACCCGCAGAAGAGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACA 1170
||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 917 GGACACGAAGAAGAGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACC 990
Query 1171 CCAGTGCGTTCCACTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCG 1244
||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 991 CCAGTGCGGTCCTCTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACG 1064
Query 1245 AGTAGCTGTGATTGCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCC 1318
.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1065 TGTCGCTGTGATAGCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCC 1138
Query 1319 TGGAGCTGATGTTGCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCC 1392
|||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1139 TGGAGCTGATGCTGCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCC 1212
Query 1393 AGCACCCCAACTGCTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCC 1466
||||||||.|||||.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1213 AGCACCCCGACTGCGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTC 1286
Query 1467 CGAGGAGGAACAGGTGAATAAGTTTGTTCTAAGTGTCCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCATGGGACTCCTCTTTG 1540
.|||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 AGAGCAAGAACAGGTGAATAAGTTTGTTTTAAGTGTTCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCATGGGACTCCTCTTTG 1360
Query 1541 TTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTGACATTGCCTTTTTCCGTGATATCCGCCAGACC 1614
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1361 TTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACTGAGTCTGACCTTGACGTTGCTTTTTTCCGAGATATCCGCCAGACC 1434
Query 1615 CCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGT 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 CCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGT 1508
Query 1689 GGTGAGCCTGCTCATTGACACC 1710
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 GGTGAGCCTGCTCATTGACACC 1530