Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04460
• Subject: XM_017317734.1
• Aligned Length: 1830
• Identities: 1398
• Gaps: 300

Alignment

Query    1  ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGTCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA  74

Query   75  CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTCCTTTGCCACCACC  148

Query  149  TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  149  TGAACCTACTTGAGAAAGACTACTTTGGGATTCGTTTTGTGGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGTTGGAGTTT  222

Query  223  ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC  296
            ||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACAAAGTCAGTGGTGAAGCAGCTGAGATCCCAGCCTCCGTTCACCATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC  296

Query  297  AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG  370
            .|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG  370

Query  371  GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  444

Query  445  GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA  517
            ||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA  517

Query  518  GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA  591
            .||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  518  AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA  591

Query  592  AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT  665
            ||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  592  AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT  665

Query  666  GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAA-------------  726
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  666  GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGTATCCTGTTTG  739

Query  727  --------------------------------------------------------------------------  726
                                                                                      
Sbjct  740  CCTCTTTTACTGCAGCCATTCACTGGGCTGGTGGCTTCAAGGATTTTTCTACAATAACCCCTAAGCCCCTTTCC  813

Query  727  TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAA  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  814  TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAA  887

Query  801  AATTATTCTTACATATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAG  874
            .||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  888  GATTATTCTCACATATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAG  961

Query  875  CCTTCTACAAGCTGGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGG  948
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  962  CCTTCTACAAGCTGGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGG  1035

Query  949  TTCCGATACAGTGGCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAAT  1022
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036  TTCCGATACAGTGGCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAAT  1109

Query 1023  ACACAGAGCAGGGATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCA  1096
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1110  ACACAGAGCAGGGATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCA  1183

Query 1097  GGACCCGCAGAAGAGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACA  1170
            ||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1184  GGACACGAAGAAGAGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACC  1257

Query 1171  CCAGTGCGTTCCACTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCG  1244
            ||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 1258  CCAGTGCGGTCCTCTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACG  1331

Query 1245  AGTAGCTGTGATTGCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCC  1318
            .||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1332  TGTCGCTGTGATAGCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCC  1405

Query 1319  TGGAGCTGATGTTGCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCC  1392
            |||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1406  TGGAGCTGATGCTGCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCC  1479

Query 1393  AGCACCCCAACTGCTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCC  1466
            ||||||||.|||||.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1480  AGCACCCCGACTGCGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTC  1553

Query 1467  CGAGGAGGAACAGGTG-AATA---AGTTTGTTCTAAG--TGTCCTC------------CGTTTGCTCCTT----  1518
            .|||.|.||||||.|| ||.|   ||...|.|||.||  .|.|.||            ||     .||||    
Sbjct 1554  AGAGCAAGAACAGATGCAAGAGAGAGACAGATCTGAGGAAGGCATCGAGAAGGAGCAGCG-----GCCTTGGAA  1622

Query 1519  GTGACCATG--GGACT--------CCTCTTTGTTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTG  1582
            |.|||||.|  |.|||        ||||                                              
Sbjct 1623  GGGACCAGGAAGCACTAAGCAGGACCTC----------------------------------------------  1650

Query 1583  ACATTGCCTTTTTCCGTGATATCCGCCAGACCCCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTC  1656
                                                                                      
Sbjct 1651  --------------------------------------------------------------------------  1650

Query 1657  AGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGTGGTGAGCCTGCTCATTGACACC  1710
                                                                  
Sbjct 1651  ------------------------------------------------------  1650