Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04460
- Subject:
- XM_017317738.1
- Aligned Length:
- 1823
- Identities:
- 1393
- Gaps:
- 304
Alignment
Query 1 ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGTCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA 74
Query 75 CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTCCTTTGCCACCACC 148
Query 149 TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT 222
||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 149 TGAACCTACTTGAGAAAGACTACTTTGGGATTCGTTTTGTGGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGTTGGAGTTT 222
Query 223 ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC 296
||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 223 ACAAAGTCAGTGGTGAAGCAGCTGAGATCCCAGCCTCCGTTCACCATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC 296
Query 297 AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG 370
.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG 370
Query 371 GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 444
||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 444
Query 445 GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA 517
||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA 517
Query 518 GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA 591
.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 518 AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA 591
Query 592 AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT 665
||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 592 AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT 665
Query 666 GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAA------------- 726
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGTATCCTGTTTG 739
Query 727 -------------------------------------------------------------------------- 726
Sbjct 740 CCTCTTTTACTGCAGCCATTCACTGGGCTGGTGGCTTCAAGGATTTTTCTACAATAACCCCTAAGCCCCTTTCC 813
Query 727 TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 814 TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAA 887
Query 801 AATTATTCTTACATATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAG 874
.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 888 GATTATTCTCACATATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAG 961
Query 875 CCTTCTACAAGCTGGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGG 948
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 962 CCTTCTACAAGCTGGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGG 1035
Query 949 TTCCGATACAGTGGCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAAT 1022
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036 TTCCGATACAGTGGCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAAT 1109
Query 1023 ACACAGAGCAGGGATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCA 1096
||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1110 ACACAGAGCAGGGATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCA 1183
Query 1097 GGACCCGCAGAAGAGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACA 1170
||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1184 GGACACGAAGAAGAGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACC 1257
Query 1171 CCAGTGCGTTCCACTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCG 1244
||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 1258 CCAGTGCGGTCCTCTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACG 1331
Query 1245 AGTAGCTGTGATTGCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCC 1318
.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1332 TGTCGCTGTGATAGCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCC 1405
Query 1319 TGGAGCTGATGTTGCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCC 1392
|||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1406 TGGAGCTGATGCTGCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCC 1479
Query 1393 AGCACCCCAACTGCTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCC 1466
||||||||.|||||.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1480 AGCACCCCGACTGCGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTC 1553
Query 1467 CGAGGAGGAACAG---GTGAATAAGTTTGTTCT-AAGTGTCCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCA----------- 1525
.|||.|.|||||| |||.| ||| |||.|.||.| .|||.| |.||
Sbjct 1554 AGAGCAAGAACAGAGAGTGCA---------TCTGAAGGGACCAC----AGCTAC-----AGCAGCAGCAGTGGA 1609
Query 1526 -----TGGGACTCCT-----CTTTGTTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTGACATTGC 1589
||||| .||| ||||
Sbjct 1610 AGGGGTGGGA-ACCTCAAGACTTT-------------------------------------------------- 1632
Query 1590 CTTTTTCCGTGATATCCGCCAGACCCCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGAT 1663
Sbjct 1633 -------------------------------------------------------------------------- 1632
Query 1664 GGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGTGGTGAGCCTGCTCATTGACACC 1710
Sbjct 1633 ----------------------------------------------- 1632