Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04555
• Subject: NM_033319.3
• Aligned Length: 1170
• Identities: 1032
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGATTCTTACAGTGCACCAGAGTCAACTCCTAGTGCATCCTCAAGACCTGAAGATTACTTTATAGGTGCCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTCTTACAGTGCACCAGAGTCAACTCCTAGTGCATCCTCAAGACCTGAAGATTACTTTATAGGTGCCAC  74

Query   75  TCCTCTGCAGAAACGATTAGAATCGGTCAGGAAGCAGAGTTCATTTATCCTGACTCCACCTCGAAGGAAAATTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCTCTGCAGAAACGATTAGAATCGGTCAGGAAGCAGAGTTCATTTATCCTGACTCCACCTCGAAGGAAAATTC  148

Query  149  CCCAGTGTTCGCAGTTGCAGGAAGATGTTGACCCTCAAAAGGTTGCATTCCTTCTGCATAAACAGTGGACTTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAGTGTTCGCAGTTGCAGGAAGATGTTGACCCTCAAAAGGTTGCATTCCTTCTGCATAAACAGTGGACTTTA  222

Query  223  TATAGTTTAACTCCCTTATATAAATTCTCCTATAGTAATCTCAAAGAGTATTCTAGACTTCTCAATGCTTTTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATAGTTTAACTCCCTTATATAAATTCTCCTATAGTAATCTCAAAGAGTATTCTAGACTTCTCAATGCTTTTAT  296

Query  297  TGTTGCTGAAAAGCAAAAAGGACTTGCTGTGGAAGTGGGAGAAGACTTCAACATCAAAGTGATTTTTTCTACTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTGCTGAAAAGCAAAAAGGACTTGCTGTGGAAGTGGGAGAAGACTTCAACATCAAAGTGATTTTTTCTACTC  370

Query  371  TCCTAGGAATGAAAGGAACACAAAGGGACCCGGAAGCATTTCTTGTCCAGGGTCTCATTTTGTCACCCAGGCTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  371  TCCTAGGAATGAAAGGAACACAAAGGGACCCGGAAGCATTTCTTGTCCA-------------------------  419

Query  445  GAGTACAGTGGCACGATCTTGGTTGACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTTCCACCTTAGCCTT  518
                                                                                      
Sbjct  420  --------------------------------------------------------------------------  419

Query  519  CCAAGTAGCTGGGACTGCAGGTGCATGCCACCACACTCGGATTGTGTCAAAATCTCAATTGCCATCTGAGAATA  592
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  ---------------------------------------GATTGTGTCAAAATCTCAATTGCCATCTGAGAATA  454

Query  593  GAGAAGGTAAAGTGCTGTGGACTGGCTGGTTCTGCTGTGTATTTGGAGACAGTCTTCTGGAGACTGTTTCAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  GAGAAGGTAAAGTGCTGTGGACTGGCTGGTTCTGCTGTGTATTTGGAGACAGTCTTCTGGAGACTGTTTCAGAA  528

Query  667  GATTTCACCTGTCTGCCCTTATTCCTTGCAAATGGAGCAGAGTCTAACACAGCAATAATTGGAACTTGGTTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  GATTTCACCTGTCTGCCCTTATTCCTTGCAAATGGAGCAGAGTCTAACACAGCAATAATTGGAACTTGGTTTCA  602

Query  741  GAAAACCTTTGACTGTTATTTCAGTCCTTTAGCAATCAATGCATTTAATCTTTCCTGGATGGCTGCCATGTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  GAAAACCTTTGACTGTTATTTCAGTCCTTTAGCAATCAATGCATTTAATCTTTCCTGGATGGCTGCCATGTGGA  676

Query  815  CTGCATGCAAAATGGACCATTATGTGGCTACTACTGAATTTCTTTGGTCTGTACCCTGTAGCCCTCAAAGTCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  CTGCATGCAAAATGGACCATTATGTGGCTACTACTGAATTTCTTTGGTCTGTACCCTGTAGCCCTCAAAGTCTG  750

Query  889  GACATTTCTTTCGCAATACATCCAGAGGATGCAAAAGCTCTATGGGACAGTGTCCACAAAACACCTGGGGAGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  GACATTTCTTTCGCAATACATCCAGAGGATGCAAAAGCTCTATGGGACAGTGTCCACAAAACACCTGGGGAGGT  824

Query  963  TACCCAGGAAGAAGTTGACCTATTCATGGATTGCCTTTATTCACATTTCCATAGACATTTCAAAATTCATTTAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  TACCCAGGAAGAAGTTGACCTATTCATGGATTGCCTTTATTCACATTTCCATAGACATTTCAAAATTCATTTAT  898

Query 1037  CAGCCACAAGATTAGTTCGTGTTTCAACATCTGTAGCTTCAGCACATACTGATGGAAAAATAAAGATTCTGTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  CAGCCACAAGATTAGTTCGTGTTTCAACATCTGTAGCTTCAGCACATACTGATGGAAAAATAAAGATTCTGTGT  972

Query 1111  CATAAATACCTTATTGGAGTGTTAGCATATTTGACAGAACTGGCAATTTTTCAAATTGAG  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  CATAAATACCTTATTGGAGTGTTAGCATATTTGACAGAACTGGCAATTTTTCAAATTGAG  1032