Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04575
• Subject: NM_026698.2
• Aligned Length: 1092
• Identities: 922
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGACAGCCCCGAGGTGACCTTCACTCTCGCCTATCTGGTGTTCGCCGTGTGCTTCGTGTTCACGCCCAACGA  74
            |||||||||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAGCCCTGAGGTGACCTTCACGTTGGCCTACCTGGTCTTCGCAGTGTGCTTCGTGTTCACGCCCAACGA  74

Query   75  GTTCCACGCGGCGGGGCTCACGGTGCAGAACCTGCTGTCGGGCTGGCTGGGCAGCGAGGACGCCGCCTTCGTGC  148
            ||||.||.||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTTCTACTCGGCCGGGCTCACAGTGCAGAATCTGTTGTCGGGCTGGCTGGGCAGCGAGGACGCCGCCTTCGTAC  148

Query  149  CCTTCCACTTGCGCCGCACGGCCGCCACGCTGTTGTGCCACTCGCTGCTGCCGCTCGGCTACTATGTGGGCATG  222
            |.|.||||.|.||||||||..|||||||.||..||||.|||||.|||||||||.|.||||||||..||||||||
Sbjct  149  CTTACCACCTTCGCCGCACTTCCGCCACACTACTGTGTCACTCACTGCTGCCGTTAGGCTACTACATGGGCATG  222

Query  223  TGCCTTGCGGCTTCAGAAAAGCGGCTCCACGCCCTCA-GCCAGGCCCCTGAGGCCTGGCGGCTCTTCCTGCTGC  295
            |||.||||.||.||||||||||.||||.||.||| || |.||||||||.||.|||||||..||||||||.||.|
Sbjct  223  TGCTTTGCAGCCTCAGAAAAGCAGCTCTACTCCC-CAGGTCAGGCCCCAGAAGCCTGGCAACTCTTCCTTCTCC  295

Query  296  TGGCCGTGACCC-TCCCCTCCATCGCCTGCATCCTGATCTACTACTGGTCCCGTGACCGGTGGGCCTGCCACCC  368
            ||||.||||||| ||||||.| ||.||||.|.|||||||||||||||||||.|.||..|||||.||.|.|||||
Sbjct  296  TGGCTGTGACCCTTCCCCTTC-TCTCCTGTACCCTGATCTACTACTGGTCCTGGGATAGGTGGACCCGACACCC  368

Query  369  ACTGGCGCGCACCCTGGCCCTCTACGCCCTCCCACAGTCTGGCTGGCAGGCTGTTGCCTCCTCTGTCAACACTG  442
            ||||||.|..||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||..|||||||.|
Sbjct  369  ACTGGCCCAAACCCTGGCCCTCTATGCCCTTCCACAGTCTGGTTGGCAGGCTGTCGCTTCTTCCATCAACACAG  442

Query  443  AGTTCCGGCGGATTGACAAGTTTGCCACCGGTGCACCAGGTGCCCGTGTGATTGTGACAGACACGTGGGTGATG  516
            |||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  443  AGTTCCGACGGATTGACAAGTTTGCTACAGGGGCACCTGGTGCCCGAGTGATTGTGACAGACACATGGGTAATG  516

Query  517  AAGGTAACCACCTACCGAGTGCACGTGGCCCAGCAGCAGGACGTGCACCTGACTGTGACGGAGTCTCGGCAGCA  590
            |||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  517  AAGGTGACCACATACCGTGTACATGTGGCTCAGCAACAGGATGTTCACTTGACTGTGACAGAGTCACGGCAGCA  590

Query  591  TGAGCTCTCGCCAGACTCGAACTTGCCCGTGCAGCTCCTCACCATCCGTGTGGCCAGCACCAACCCTGCTGTG-  663
            |||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||.|||||    | 
Sbjct  591  TGATCTCTCGCCAGACTCAAACCTACCTGTGCAGCTTCTTACTATACGTGTGGCAAGCACCAGCCCTG----GC  660

Query  664  ---CAGGCCTTTGACATCTGGCTGAACTCCACTGAGTACGGGGAGCTCTGCGAGAAGCTCCGGGCACCCATCCG  734
               |||.|||||||.||..|||||||.||..|.||.||.||.||.||.||.||||||||||..||.||.|||||
Sbjct  661  ACACAGCCCTTTGATATTCGGCTGAATTCATCAGAATATGGCGAACTATGTGAGAAGCTCCACGCCCCAATCCG  734

Query  735  CAGGGCAGCCCATGTGGTCATCCACCAGAGCCTGGGCGACCTGTTCCTGGAGACATTTGCCTCCCTGGTAGAGG  808
            .||.||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||..||.||||
Sbjct  735  AAGTGCAGCCAATGTGGTCATCCGCCAGAGCCTGGGGGACCTCTTCCTAGAAACATTTGCTTCCCATGTGGAGG  808

Query  809  TCAACCCGGCCTACTCAGTGCCCAGCAGCCAGGAGCTGGAGGCCTGCATAGGCTGCATGCAGACACGTGCCAGC  882
            |||||||.|||||.|||||.|||||||.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  809  TCAACCCAGCCTATTCAGTACCCAGCAACCAGGAGCTGGAGCCCTGTATAGGCTGCATGCAAACACGGGCCAGC  882

Query  883  GTGAAGCTGGTGAAGACCTGCCAGGAGGCAGCCACAGGCGAGTGCCAGCAGTGTTACTGCCGCCCCATGTGGTG  956
            ||||||.|||||||||||||.||||||.||||....||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  883  GTGAAGTTGGTGAAGACCTGTCAGGAGCCAGCGGTCGGCGAGTGCCAGCAGTGTTACTGCCGACCCATGTGGTG  956

Query  957  CCTCACCTGCATGGGCAAGTGGTTCGCCAGCCGCCAGGACCCCCTGCGCCCTGACACCTGGCTGGCCAGCCGCG  1030
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  957  TCTCACTTGCATGGGCAAGTGGTTTGCCAGCCGCCAGGATCCCCAGCGCCCTGACACTTGGCTAGCCAGCCGTG  1030

Query 1031  TGCCCTGCCCCACCTGCCGCGCACGCTTCTGCATCCTGGATGTGTGCACCGTGCGC  1086
            |||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||...||.|||
Sbjct 1031  TGCCCTGCCCCACTTGCCGTGCCCGCTTCTGCATCCTGGATGTGTGCTGTGTACGC  1086