Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04582
• Subject: NM_175935.3
• Aligned Length: 1038
• Identities: 887
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGTCCACGCTGGGCGCGGGCATCGTGATAGCCGAGGCGCTACAGAACCAGCTAGCCTGGCTGGAGAACGT  74
            |||||||||||||||.|||||||||||.|.||.||.||.||.||||||||||.|||..||.||||.|||||..|
Sbjct    1  ATGGAGTCCACGCTGAGCGCGGGCATCATAATGGCTGAAGCACTACAGAACCGGCTTCCCGGGCTAGAGAATAT  74

Query   75  GTGGCTCTGGATCACCTTTCTGGGCGATCCCAAGATCCTCTTTCTGTTCTACTTCCCCGCGGCCTACTACGCCT  148
            ||||||||||.|||||||||||||||||||.||||..||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGGCTCTGGGTCACCTTTCTGGGCGATCCTAAGAATCTTTTTCAGTTCTGCTTCCCCGCGGCCTACTACGCCT  148

Query  149  CCCGCCGTGTGGGCATCGCGGTGCTCTGGATCAGCCTCATCACCGAGTGGCTCAACCTCATCTTCAAGTGGTTT  222
            |||||||..||||||||.|.|||||||||||||.|.||||..|.||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  149  CCCGCCGCCTGGGCATCTCCGTGCTCTGGATCACCTTCATTGCTGAGTGGCTCAACCTTGTCTTCAAGTGGTTT  222

Query  223  CTTTTTGGAGACAGGCCCTTTTGGTGGGTCCATGAGTCTGGTTACTACAGCCAGGCTCCAGCCCAGGTTCACCA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||.||.||||.|||||..||||.|||||||
Sbjct  223  CTGTTTGGAGACAGGCCCTTTTGGTGGGTGCATGAATCCGGGTACTCCACCCAGACTCCAATCCAGATTCACCA  296

Query  297  GTTCCCCTCTTCTTGTGAGACTGGTCCAGGCAGCCCTTCTGGACACTGCATGATCACAGGAGCAGCCCTCTGGC  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  297  GTTCCCTTCTTCTTGTGAGACTGGTCCAGGCAGCCCCTCCGGCCACTGCATGATCACAGGCGCAGCTCTTTGGC  370

Query  371  CCATAATGACGGCCCTGTCTTCGCAGGTGGCCACTCGGGCCCGCAGCCGCTGGGTAAGGGTGATGCCTAGCCTG  444
            |..|||||||||||.|.|||||.||||||||..|||||.|||||||||.||||||.||||||||.|||.|||||
Sbjct  371  CTGTAATGACGGCCATTTCTTCTCAGGTGGCTTCTCGGTCCCGCAGCCCCTGGGTGAGGGTGATTCCTGGCCTG  444

Query  445  GCTTATTGCACCTTCCTTTTGGCGGTTGGCTTGTCGCGAATCTTCATCTTAGCACATTTCCCTCACCAGGTGCT  518
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.||..|||||.||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  445  GCTTATTGTACCTTCCTATTGGCAGTCGGCCTATCTCGGGTCTTCCTCTTAGCACATTTCCCTCACCAAGTGTT  518

Query  519  GGCTGGCCTAATAACTGGCGCTGTCCTGGGCTGGCTGATGACTCCCCGAGTGCCTATGGAGCGGGAGCTAAGCT  592
            ||..|||||.||...|||.||||.|||.||||||||.||||..|||||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GGGCGGCCTTATTGTTGGTGCTGCCCTTGGCTGGCTAATGAGCCCCCGGGTACCCATGGAGCGGGAGCTTAGCT  592

Query  593  TCTATGGGTTGACTGCACTGGCCCTCATGCTAGGCACCAGCCTCATCTATTGGACCCTCTTTACACTGGGCCTG  666
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  TTTATGGGTTGACTGCTCTGGCCCTCATGCTGGGTGCCAGCCTCATGTATTGGACTCTCTTTACACTGGGCCTA  666

Query  667  GATCTTTCTTGGTCCATCAGCCTAGCCTTCAAGTGGTGTGAGCGGCCTGAGTGGATACACGTGGATAGCCGGCC  740
            ||||||||.||||||||||.|||.||.|.||||||||||||.|||||.||||||.|.|||.||||.||.|||||
Sbjct  667  GATCTTTCCTGGTCCATCAACCTGGCTTCCAAGTGGTGTGAACGGCCCGAGTGGGTGCACATGGACAGTCGGCC  740

Query  741  CTTTGCCTCCCTGAGCCGTGACTCAGGGGCTGCCCTGGGCCTGGGCATTGCCTTGCACTCTCCCTGCTATGCCC  814
            .||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTGCCTCACTGAGCCGTGACTCAGGATCTGCCCTGGGTCTGGGCATTGCCCTCCACACTCCCTGCTATGCCC  814

Query  815  AGGTGCGTCGGGCACAGCTGGGAAATGGCCAGAAGATAGCCTGCCTTGTGCTGGCCATGGGGCTGCTGGGCCCC  888
            ||.|.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||.|..|
Sbjct  815  AGATACGGCGGGCGCACCTAGGGAATGGCCAGAAAATAGCTTGCTTTGTGCTGGCCATGGGGCTGCTGGTCTTC  888

Query  889  CTGGACTGGCTGGGCCACCCCCCTCAGATCAGCCTCTTCTACATTTTCAATTTCCTCAAGTACACCCTCTGGCC  962
            |||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  CTGGAATGGCTGGGCTACCCACCTCAGATCAGCCTCTTCTACATCTTCAACTTCCTCAAGTATACCCTCTGGCC  962

Query  963  ATGCCTAGTCCTGGCCCTCGTGCCCTGGGCAGTGCACATGTTCAGTGCCCAGGAAGCACCGCCCATCCACTCTT  1036
            .|||||.|||.|||||||.||||||||||..|||||||..||.||||.||||||||||||||||||.|.|||.|
Sbjct  963  GTGCCTGGTCTTGGCCCTTGTGCCCTGGGTGGTGCACACATTGAGTGACCAGGAAGCACCGCCCATTCGCTCCT  1036

Query 1037  CC  1038
            |.
Sbjct 1037  CT  1038