Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04593
• Subject: NM_180600.3
• Aligned Length: 1137
• Identities: 1057
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGTCCGTGTCAGGGCTCAAGGCCGAGCTGAAGTTCCTGGCGTCCATCTTCGACAAGAACCACGAGCGATTCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGTGTCAGGGCTCAAGGCCGAGCTGAAGTTCCTGGCGTCCATCTTCGACAAGAACCACGAGCGATTCCG  74

Query   75  CATCGTCAGTTGGAAGCTGGACGAGCTGCACTGCCAGTTCCTGGTGCCG------------CAGCAGGGCAGCC  136
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |.||.|||||||.
Sbjct   75  CATCGTCAGCTGGAAGCTGGACGAGCTGCACTGCCAGTTCCTGGTGCCGCCGCCGCCACCACCGCCGGGCAGCT  148

Query  137  CGCACTCGCTGCCGCCGCCACTCACGCTCCACTGCAACATCACGGAATCCTATCCATCTTCTTCACCGATATGG  210
            |||..||||.|||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CGCTTTCGCCGCCGCCGCCGCTCACACTTCACTGCAACATCACGGAATCTTACCCATCTTCTTCACCAATATGG  222

Query  211  TTTGTGGATTCTGAAGACCCAAATCTGACATCAGTTCTGGAACGTCTAGAAGATACTAAGAACAACAATTTGCT  284
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  223  TTTGTGGACTCTGATGACCCAAATCTGACATCAGTTCTGGAACGCTTAGAAGATACTAAGAACAACAGTTCGCT  296

Query  285  TCGTCAGCAATTGAAGTGGTTGATATGTGAACTCTGCAGTTTATATAACCTTCCTAAGCACCTGGATGTTGAGA  358
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGTCAGCAATTGAAGTGGTTGATATGTGACCTCTGCAGATTATATAACCTTCCTAAGCACCTGGATGTTGAGA  370

Query  359  TGCTAGATCAACCACTACCCACGGGTCAGAATGGGACAACAGAAGAAGTGACTTCAGAAGAAGAGGAAGAAGAA  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||   |||||.
Sbjct  371  TGCTAGATCAACCACTACCCACGGGTCAGAATGGGACAACTGAAGAAGTAACTTCAGAAGAAGAG---GAAGAG  441

Query  433  GAAGAGATGGCTGAAGATATAGAAGACTTAGATCACTATGAGATGAAGGAAGAAGAGCCTATTAGTGGGAAAAA  506
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  442  GAGGAGATGGCTGAAGATATAGAAGACTTGGATCACTATGAGATGAAGGAAGAAGAACCTATTAATGGGAAAAA  515

Query  507  GTCAGAGGATGAAGGAATTGAAAAAGAAAATTTGGCAATATTAGAGAAAATTAGGAAGACTCAAAGGCAAGACC  580
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GTCAGAGGATGAAGGGATTGAAAAAGAAAATTTGGCAATATTAGAGAAAATCAGGAAGACTCAAAGGCAAGACC  589

Query  581  ATTTAAATGGTGCAGTGTCTGGGTCAGTGCAAGCTTCAGATAGACTTATGAAAGAGCTCAGGGACATATACAGA  654
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.||||||
Sbjct  590  ATTTAAATGGTGCAGTGTCTGGGTCAGTACAAGCATCAGACAGACTGATGAAGGAGCTCAGGGACGTCTACAGA  663

Query  655  TCACAGAGTTATAAAACAGGGATTTATTCAGTGGAACTCATAAATGACAGTTTATATGACTGGCATGTTAAACT  728
            ||||||||.||.||..|||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  664  TCACAGAGCTACAAGGCAGGGATTTATTCAGTGGAGCTAATAAATGACAGCTTATATGACTGGCATGTCAAACT  737

Query  729  GCAGAAGGTTGACCCTGATAGTCCTTTGCACAGTGATCTTCAGATCTTAAAAGAAAAAGAAGGCATAGAATATA  802
            .||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  ACACAAGGTTGACTCTGATAGTCCTTTGCACAGTGATCTTCAGATCTTAAAAGAAAAAGAAGGCATAGAATATA  811

Query  803  TTTTGCTTAACTTCTCTTTTAAGGATAACTTTCCATTTGATCCTCCATTTGTTCGAGTGGTGTTACCTGTTCTC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TTTTGCTTAACTTCTCTTTTAAGGATAATTTTCCATTTGATCCTCCGTTTGTTAGAGTGGTGTTACCTGTTCTC  885

Query  877  TCAGGAGGGTATGTATTGGGTGGAGGAGCATTATGTATGGAACTTCTCACAAAACAGGGCTGGAGCAGTGCCTA  950
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  TCAGGAGGGTATGTGTTGGGTGGAGGAGCACTTTGTATGGAACTTCTCACAAAACAGGGCTGGAGCAGTGCCTA  959

Query  951  CTCAATAGAATCGGTCATCATGCAAATAAATGCCACCTTAGTCAAAGGCAAAGCCAGAGTGCAGTTTGGAGCAA  1024
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  960  CTCAATAGAATCTGTCATCATGCAGATCAATGCCACCTTAGTGAAAGGCAAAGCCCGGGTGCAGTTTGGAGCAA  1033

Query 1025  ATAAGAATCAATATAATCTAGCAAGAGCCCAACAATCCTATAATTCCATTGTACAGATACATGAGAAAAATGGC  1098
            ||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  ATAAGAATCAGTATAATCTAGCACGAGCCCAACAGTCCTATAATTCCATTGTACAGATACATGAGAAAAATGGC  1107

Query 1099  TGGTACACCCCTCCAAAGGAAGATGGC  1125
            ||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TGGTACACACCTCCAAAGGAAGATGGC  1134