Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04687
• Subject: NM_001330452.2
• Aligned Length: 1347
• Identities: 1041
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ATGGCTTTAGACATTCTCGCCATGGCCCCTTTGTATCAGGCCCCTGCCATCAACAGAATAGGGCCAAAGACAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTTAGACATTCTCGCCATGGCCCCTTTGTATCAGGCCCCTGCCATCAACAGAATAGGGCCAAAGACAGA  74

Query   75  CCCATCTAAAAGGCCAGCTGATCCACTAAAACCCTTGGTTCTCTCTAGGACCAAACTCACCACCATTGAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATCTAAAAGGCCAGCTGATCCACTAAAACCCTTGGTTCTCTCTAGGACCAAACTCACCACCATTGAGGCCA  148

Query  149  AAAGGATCATGTCCATCCTGGATGAGGCGATCTACAAGGTGGAGCTGGTGACCTTGCTGTCGTATGTGGCATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAGGATCATGTCCATCCTGGATGAGGCGATCTACAAGGTGGAGCTGGTGACCTTGCTGTCGTATGTGGCATCC  222

Query  223  AACAGAGAGGATATGGAGGGGATGCTGGGGGAGGACGTCATGAGGGCAGTGAGAGAGCATGAGGATCTCTGCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACAGAGAGGATATGGAGGGGATGCTGGGGGAGGACGTCATGAGGGCAGTGAGAGAGCATGAGGATCTCTGCCA  296

Query  297  GGTCCTCCTTGAAAACGTCAGGTGCCTGAAAGAGAAAGAAAGGCAATTGCAGGAGCAGAAAGAGGCTGAGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCCTCCTTGAAAACGTCAGGTGCCTGAAAGAGAAAGAAAGGCAATTGCAGGAGCAGAAAGAGGCTGAGGAGG  370

Query  371  AAGGGTGGCTCAGAGACCGCCTCCTTTCCATAGAGCTGCAGAAATCCAGCCTCTCACCACTTATGCAGCAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGGTGGCTCAGAGACCGCCTCCTTTCCATAGAGCTGCAGAAATCCAGCCTCTCACCACTTATGCAGCAGATC  444

Query  445  AAAGACTCCACCAAGAACGTCCTTAGACTCTTGCTCAGCAACCCCCAGGCTGCTAGGCTCCTGCAGATGCAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGACTCCACCAAGAACGTCCTTAGACTCTTGCTCAGCAACCCCCAGGCTGCTAGGCTCCTGCAGATGCAGAC  518

Query  519  ACAGGGTAGAAGTGCAGAAGCCCAGAATTTTATTGACAGCCTGATAGAGCTCCGTGGTTTCCTGTTTGAAAAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGGGTAGAAGTGCAGAAGCCCAGAATTTTATTGACAGCCTGATAGAGCTCCGTGGTTTCCTGTTTGAAAAAC  592

Query  593  TACTCACTAGTCCCATGGAAGCGAGGGATAAGGCCCAGTTCTTACAGGATATCAGTAGACAGAATAGTAATAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TACTCACTAGTCCCATGGAAGCGAGGGATAAGGCCCAGTTCTTACAGGATATCAGTAGACAGAATAGTAATAAC  666

Query  667  CAACAAATCATTGATACTCTTGAAAAGGAATTGGCGGAGAGAATGAAGAACAGGAATGCAG-------------  727
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  667  CAACAAATCATTGATACTCTTGAAAAGGAATTGGCGGAGAGAATGAAGAACAGGAATGCAGAGGTGGAAAAGGA  740

Query  728  --------------------------------------------------------------------------  727
                                                                                      
Sbjct  741  GAACTTTGTGATCCAAGAACTGAAAAACCACCTGCACCAGGTGCTCAAGTTCTCAGAGAACAGCCTCGTTCGCA  814

Query  728  --------------------------------------------------------------------------  727
                                                                                      
Sbjct  815  CTAAGCAGGAGGCTGAGAAGCAGCAGAAGGCCGATTTCCGGGCATCACAGGCCAGGGTGGCCAAGATCCAGCAG  888

Query  728  --------------------------------------------------------------------------  727
                                                                                      
Sbjct  889  GAGATCCTGCAGCTGCAGTCACAGTTTTACAACCTGGTCATGGAGAACCGGGAGGCAGAGCAGGCGCTGAGGAA  962

Query  728  -----------------------------------------------------------------------AGG  730
                                                                                   |||
Sbjct  963  GAAGAAATATAAAGTGGAAACGGAAATCGAGAACTGGATCCAGAAATATGATACAGAGATGGGTGAGAAGCAGG  1036

Query  731  AGGAGTTGGAGGATCTGGACGCTGTTCACAGGGAGGAGAAGATCTCGCTGGAGGAGCTCAGGCGGAGGCACAAA  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGTTGGAGGATCTGGACGCTGTTCACAGGGAGGAGAAGATCTCGCTGGAGGAGCTCAGGCGGAGGCACAAA  1110

Query  805  GTGCTGGTGGGAGAGTTTGCGCAGATCCGGGAAGAGCGGGAGATCAACTCCAAGAAAAGGATGGAGGCAGAGCA  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGCTGGTGGGAGAGTTTGCGCAGATCCGGGAAGAGCGGGAGATCAACTCCAAGAAAAGGATGGAGGCAGAGCA  1184

Query  879  GGAGATGGTGCGCATGGTACGGGCGGCCACGCTCATCCAGGCCCTATGGAAGGGCTATCTGGTGCGCTCCCTGC  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATGGTGCGCATGGTACGGGCGGCCACGCTCATCCAGGCCCTATGGAAGGGCTATCTGGTGCGCTCCCTGC  1258

Query  953  TCAGATCCAAGAAGAAGCGGGGCAAGGGCAAAGCAAAGGACAAGGAGAAGGGCAAGCAGAAAGGCAAGGAGAAG  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGATCCAAGAAGAAGCGGGGCAAGGGCAAAGCAAAGGACAAGGAGAAGGGCAAGCAGAAAGGCAAGGAGAAG  1332

Query 1027  GGCAAGGGCAAGAAA  1041
            |||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAAGGGCAAGAAA  1347