Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04687
• Subject: XM_011537864.2
• Aligned Length: 1113
• Identities: 1041
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGCTTTAGACATTCTCGCCATGGCCCCTTTGTATCAGGCCCCTGCCATCAACAGAATAGGGCCAAAGACAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTTAGACATTCTCGCCATGGCCCCTTTGTATCAGGCCCCTGCCATCAACAGAATAGGGCCAAAGACAGA  74

Query   75  CCCATCTAAAAGGCCAGCTGATCCACTAAAACCCTTGGTTCTCTCTAGGACCAAACTCACCACCATTGAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATCTAAAAGGCCAGCTGATCCACTAAAACCCTTGGTTCTCTCTAGGACCAAACTCACCACCATTGAGGCCA  148

Query  149  AAAGGATCATGTCCATCCTGGATGAGGCGATCTACAAGGTGGAGCTGGTGACCTTGCTGTCGTATGTGGCATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAGGATCATGTCCATCCTGGATGAGGCGATCTACAAGGTGGAGCTGGTGACCTTGCTGTCGTATGTGGCATCC  222

Query  223  AACAGAGAGGATATGGAGGGGATGCTGGGGGAGGACGTCATGAGGGCAGTGAGAGAGCATGAGGATCTCTGCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACAGAGAGGATATGGAGGGGATGCTGGGGGAGGACGTCATGAGGGCAGTGAGAGAGCATGAGGATCTCTGCCA  296

Query  297  GGTCCTCCTTGAAAACGTCAGGTGCCTGAAAGAGAAAGAAAGGCAATTGCAGGAGCAGAAAGAGGCTGAGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCCTCCTTGAAAACGTCAGGTGCCTGAAAGAGAAAGAAAGGCAATTGCAGGAGCAGAAAGAGGCTGAGGAGG  370

Query  371  AAGGGTGGCTCAGAGACCGCCTCCTTTCCATAGAGCTGCAGAAATCCAGCCTCTCACCACTTATGCAGCAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGGTGGCTCAGAGACCGCCTCCTTTCCATAGAGCTGCAGAAATCCAGCCTCTCACCACTTATGCAGCAGATC  444

Query  445  AAAGACTCCACCAAGAACGTCCTTAGACTCTTGCTCAGCAACCCCCAGGCTGCTAGGCTCCTGCAGATGCAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGACTCCACCAAGAACGTCCTTAGACTCTTGCTCAGCAACCCCCAGGCTGCTAGGCTCCTGCAGATGCAGAC  518

Query  519  ACAGGGTAGAAGTGCAGAAGCCCAGAATTTTATTGACAGCCTGATAGAGCTCCGTGGTTTCCTGTTTGAAAAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGGGTAGAAGTGCAGAAGCCCAGAATTTTATTGACAGCCTGATAGAGCTCCGTGGTTTCCTGTTTGAAAAAC  592

Query  593  TACTCACTAGTCCCATGGAAGCGAGGGATAAGGCCCAGTTCTTACAGGATATCAGTAGACAGAATAGTAATAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TACTCACTAGTCCCATGGAAGCGAGGGATAAGGCCCAGTTCTTACAGGATATCAGTAGACAGAATAGTAATAAC  666

Query  667  CAACAAATCATTGATACTCTTGAAAAGGAATTGGCGGAGAGAATGAAGAACAGGAATGCAG-------------  727
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  667  CAACAAATCATTGATACTCTTGAAAAGGAATTGGCGGAGAGAATGAAGAACAGGAATGCAGAGAAGAAATATAA  740

Query  728  -----------------------------------------------------------AGGAGGAGTTGGAGG  742
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGGAAACGGAAATCGAGAACTGGATCCAGAAATATGATACAGAGATGGGTGAGAAGCAGGAGGAGTTGGAGG  814

Query  743  ATCTGGACGCTGTTCACAGGGAGGAGAAGATCTCGCTGGAGGAGCTCAGGCGGAGGCACAAAGTGCTGGTGGGA  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCTGGACGCTGTTCACAGGGAGGAGAAGATCTCGCTGGAGGAGCTCAGGCGGAGGCACAAAGTGCTGGTGGGA  888

Query  817  GAGTTTGCGCAGATCCGGGAAGAGCGGGAGATCAACTCCAAGAAAAGGATGGAGGCAGAGCAGGAGATGGTGCG  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTTTGCGCAGATCCGGGAAGAGCGGGAGATCAACTCCAAGAAAAGGATGGAGGCAGAGCAGGAGATGGTGCG  962

Query  891  CATGGTACGGGCGGCCACGCTCATCCAGGCCCTATGGAAGGGCTATCTGGTGCGCTCCCTGCTCAGATCCAAGA  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGGTACGGGCGGCCACGCTCATCCAGGCCCTATGGAAGGGCTATCTGGTGCGCTCCCTGCTCAGATCCAAGA  1036

Query  965  AGAAGCGGGGCAAGGGCAAAGCAAAGGACAAGGAGAAGGGCAAGCAGAAAGGCAAGGAGAAGGGCAAGGGCAAG  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAGCGGGGCAAGGGCAAAGCAAAGGACAAGGAGAAGGGCAAGCAGAAAGGCAAGGAGAAGGGCAAGGGCAAG  1110

Query 1039  AAA  1041
            |||
Sbjct 1111  AAA  1113