Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04688
• Subject: XM_006519063.3
• Aligned Length: 1200
• Identities: 884
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCCAGCCACTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGGTCGAGGGGTCGCAGGA  74

Query   75  GGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCATCAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTG  148
            ||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGTCAACATGGCGGTGATTGTACCTAAAGAAGAGGGTGTCATCAGCGTCTCGGAGGACAGGACAGTTCGTG  148

Query  149  TTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTGGTTAAAGAGGGACAGTGGACAGTACTGGCCAAGCATCTACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222

Query  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATTTTGTCTGA  296

Query  297  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  370
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct  297  AGATTATAACAAGATGACACCTGTGAAAAACTATCAAGCACATCAGAGCAGAGTAACGATGGTCCTGTTTGTTC  370

Query  371  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  444
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TGGAACTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAGTTCGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGACAGCGC  444

Query  445  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  518
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  CTGGGAGGTTACCGCACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGTCATGTGTTTATTGG  518

Query  519  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  592
            .||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||.|.||||||||.|
Sbjct  519  CGATCACTCGGGCCAAGTAACCATCCTCAAACTGGAACAAGAAAACTGCACACTGCTCACATCCTTCAGAGGGC  592

Query  593  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  666
            |||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  ACACAGGAGGGGTGACAGCACTCTGCTGGGACCCGGTGCAGCGCGTGCTATTCTCAGGCAGTTCCGATCACTCT  666

Query  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGCACGGCCATCGAACTCCAAGGACACAATGACAAAGTCCAGGC  740

Query  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  814
            |||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACACGACAGCTCATCTCATGTGGCGGTGACGGTGGCATTGTCGTCTGGAACATGG  814

Query  815  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  888
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTGGAAAGGCAGGAGACCCCTGAGTGGTTGGACAGTGACTCCTGCCAAAAGTGTGACCAGCCTTTCTTCTGG  888

Query  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||                             
Sbjct  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGACTAAGACAG-----------------------------  933

Query  963  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  1036
                                                                                      
Sbjct  934  --------------------------------------------------------------------------  933

Query 1037  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  1110
                                        |||.||.|||||||||||||||||                      
Sbjct  934  ----------------------------ACGCGCCCCCACAGCCACCTTCCA----------------------  957

Query 1111  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATAT  1184
                                                                                      
Sbjct  958  --------------------------------------------------------------------------  957

Query 1185  GACCCCAGTCGTGTCT  1200
                            
Sbjct  958  ----------------  957