Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04688
• Subject: XM_017020386.1
• Aligned Length: 1200
• Identities: 933
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATCCTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCATCAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACCATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATG  222
                                                         ||||||||||||                 
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGCAATGCCTT-----------------  12

Query  223  TCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAATGGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGA  296
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct   13  ---------------------------------------------------------GAGTTTATATTGTCAGA  29

Query  297  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  AGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCAGAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCC  103

Query  371  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  TGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTGCCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGC  177

Query  445  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  CTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTTGATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGG  251

Query  519  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  TGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAACTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGAC  325

Query  593  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  ACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGGTGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCT  399

Query  667  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  GTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAGCTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGC  473

Query  741  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  CCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGGTGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGG  547

Query  815  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  ACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCTGCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGG  621

Query  889  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  AACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAGCACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGT  695

Query  963  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  CTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGGCTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACA  769

Query 1037  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  GCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAACGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTG  843

Query 1111  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  CATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATGGTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATAT  917

Query 1185  GACCCCAGTCGTGTCT  1200
            ||||||||||||||||
Sbjct  918  GACCCCAGTCGTGTCT  933