Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04697
- Subject:
- NM_001177790.1
- Aligned Length:
- 1697
- Identities:
- 1417
- Gaps:
- 58
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGC-TGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCA 73
||| ||.|.|..|||..||| ||| .||| |||.||.|||| .||.|.||| ||||
Sbjct 1 ATG--CGTGGCCAAGGCAGGG---GGCACGCC------CGCTGGCCCGC----------GCCTCTGCG--CTCA 51
Query 74 CCGACTCC-------TCGGC-------CACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAA 133
|.| ||.| |.||| ||||.||.| ||||.||..|| |.|.|||||||||||||||||
Sbjct 52 CTG-CTGCGTGCCTTTGGGCCCCAAGACACCACCAC--CGGAGGCTTGG----AGCAAGATGAGATGGACCAAA 118
Query 134 CGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCC 207
|.|||||.||.||..|.||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 119 CTCCCCCAGCACGCTCAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCC 192
Query 208 ACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGC 281
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 193 ACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGC 266
Query 282 GCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGC 355
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 267 GCTGGAGAAGAAGATGGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCAAGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGC 340
Query 356 AGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAG 429
|.|||.||||||..||..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||||.||||||||.||.|||.||..|.||
Sbjct 341 AAGATTCTGAAAATAAGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCTGTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAG 414
Query 430 TCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGA 503
..||||||||||||.||.||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||.|||||.||||.|||
Sbjct 415 CAGGAGACGCTGACCTCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGCCAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGA 488
Query 504 CAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAG 577
..|||..||||||||.|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.||.||||||||||.||..||||||||||
Sbjct 489 TGAGCTTCTGTCCTCCGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATACCGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAG 562
Query 578 ACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCT 651
|||||||||||||||||||||||||..||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 563 ACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTAGCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCT 636
Query 652 CCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAG 725
||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 637 CCCAGATCCCTGGAGAGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACTGCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAG 710
Query 726 CTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGA 794
|||.|||.|||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||||.|.|||||||||||| |.||||
Sbjct 711 CTCTAAAGCCACAAAAAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAGGCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG- 783
Query 795 CCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCC 868
.|.|||.|.||.|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 784 ----GCTCTCAGAGGACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATGTCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCC 853
Query 869 CAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAA 942
|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|.|||
Sbjct 854 CCAGCCGCGTGATGGAGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCACCGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAA 927
Query 943 AGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAG 1016
.|.|.|||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 928 TGCAGAGGGTCTCCAAAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGACGTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAG 1001
Query 1017 GGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGG 1090
|||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||.|.||.||..|.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1002 GGACGAGGCGTGGAGCTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGGCTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGG 1075
Query 1091 AGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCC 1164
||||.|||||..|.|..||.||.|||||.||.|||.||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1076 AGAATCTGATGCTGAGCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCC 1149
Query 1165 ATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAA 1238
||.||.||.|||||..||||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1150 ATCATCTCGGGAACTTTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGCAGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAA 1223
Query 1239 ACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCG 1312
.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1224 GCAGGAGCTAGAGGACCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGGAGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAG 1297
Query 1313 AGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAA 1386
||||||||||.||||| |||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1298 AGATGAAGCTGTCCAA---GCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAACTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAA 1368
Query 1387 AGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACC 1460
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1369 AGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAGATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACC 1442
Query 1461 CACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGG 1534
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1443 CACTGTTGATGAATTGAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTGATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGG 1516
Query 1535 ACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTA 1608
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 ACTATGACAGGAGGGCAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTA 1590
Query 1609 AATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 AATGAATATAAAAGTAACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1659