Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04697
• Subject: NM_001199505.1
• Aligned Length: 1702
• Identities: 1629
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGC-CGCTCGCAGAGTG------ACCCCAGCG  67
            ||    ||||              |||     ||||.||.||||| |||.|||    ||      .||||.|||
Sbjct    1  AT----GCGT--------------GGC-----CGTGGCGGGGGGCGCGCCCGC----TGTCCTGCGCCCCTGCG  47

Query   68  TCCTCAC-------CGACTCCTCGGCC----AC-CT-CCTCCGCGGACGCCGGGGAGAAC-----CCAGATGAG  123
              |||.|       ||.||.|..||||    || || ||.||||   ||||  .||||.|     |.|||||||
Sbjct   48  --CTCGCTGCTGGGCGCCTTCGGGGCCCGGGACGCTGCCGCCGC---CGCC--CGAGATCCTGCGCAAGATGAG  114

Query  124  ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTCCTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAG  188

Query  198  CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  189  CAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATCTTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGA  262

Query  272  CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  CAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGATGGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAG  336

Query  346  ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  ATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCAAAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACC  410

Query  420  CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACTTCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGG  484

Query  494  TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGT  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  TCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTCAGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGT  558

Query  568  GAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCT  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  GAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCCTGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCT  632

Query  642  GGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCAC  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAGAGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCAC  706

Query  716  CCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  CCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAAAAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGT  780

Query  790  GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCT  854

Query  864  TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAA  928

Query  938  GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  GAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAG  1002

Query 1012  GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAA  1076

Query 1086  CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  CAAGGAGAACCTGATCATAAATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACG  1150

Query 1160  ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  ACTCCATTATTTCTGGAACACTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCA  1224

Query 1234  AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  AGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCA  1298

Query 1308  GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  GATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGA  1372

Query 1382  AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  AACAAAGGAATGATCAGACAGAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAG  1446

Query 1456  AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC  1529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  AGACCCACTGTTGATGAATTAAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGC  1520

Query 1530  GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG  1603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  GCAGGACTATGACAGGAGGGCAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAG  1594

Query 1604  AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595  AATTAAATGAGTACAAAAGTAATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA  1668