Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04697
- Subject:
- NM_028806.2
- Aligned Length:
- 1682
- Identities:
- 1459
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC 74
||||||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1 ATGGCCGCATCCGAGGACGGCAGCAGCTGCCTTGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCTTCCTCAG 74
Query 75 CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC 148
|||||||||.|||| |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..
Sbjct 75 CGACTCCTCAGCCA---CCTCCACGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACTCCCCCAGCACGCT 145
Query 149 CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC 222
|.||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 146 CAGAGCCTCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAGCTGGCCACCCTGGGCAGGATC 219
Query 223 TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 296
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 TTCAAACCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAGAAACTGAAGCAGACGACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 293
Query 297 GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA 370
|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||..|
Sbjct 294 GGCTGGCAGGCAAGGCCGGGAGGAACTCATCAAGCAGGGACTGCTGGAGATGATGGAGCAAGATTCTGAAAATA 367
Query 371 AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT 444
|..|.||||..|||.|.|.|||..|||.|.||||.||||||||.||.|||.||..|.||..||||||||||||.
Sbjct 368 AGGCATGCAGTCCCAAGGAAGGCTCCCAACCTGTGCAGAGTGAGCCGCCCGCTGGCGAGCAGGAGACGCTGACC 441
Query 445 TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC 518
||.||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||.|||||.||||.|||..|||..||||||||
Sbjct 442 TCGGAGGGCGCCCAGCCCGGAAGCCCCTCGGCCAGTGGAACAGATCAGGTGTCCCAGGATGAGCTTCTGTCCTC 515
Query 519 AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC 592
.|.|||.||..||||.|||.|||||||.||.||.||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CGATGCTCATCTGGATGATACAGCCAATATACCGTCTGCATCCACTGCGGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC 589
Query 593 TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG 666
||||||||||..||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 590 TGCCCACCACTGATGAGCCCTCTCAAGCCTTAGCTGGGTCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGATCCCTGGAG 663
Query 667 AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA 740
|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||
Sbjct 664 AGATCTGTGAGCCAGCTCCCCAGCCCTCCACTGCTGCCCACCCCGCCACCCAAGGCCAGCTCTAAAGCCACAAA 737
Query 741 AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGA-----GTGCCGACCCTTCCCTCCGGGG 809
||||||||||||.|||||..|.||||||||||.|.|||||||||||| |.|||| .|.|||.|.||
Sbjct 738 AAATGTCACAGGACAAGCTGCGCTCTTCCAAGGCCCCAGCATGAAGAACAATGAGCCG-----GCTCTCAGAGG 806
Query 810 CCAGCTCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTG 883
.|||||..||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 807 ACAGCTTGCCACCCCCACAGGGTCCCCTCATGTCACCACTGTCCACCGGCCACTGCCCCCCAGCCGCGTGATGG 880
Query 884 AGGAGCTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCA 957
||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|.|||.|.|.||||||||||
Sbjct 881 AGGAGCTGCATAGGGCACTGGCTACAAAGCACCGTCAGGACAGTTTTCAAGGGCGGGAATGCAGAGGGTCTCCA 954
Query 958 AAGAAGCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAG 1031
|||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 955 AAGAAGCGGATGGATGTGCGTCTGTCTAGGACGTCCAGCATGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGACGAGGCGTGGAG 1028
Query 1032 CTTTGACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAA 1105
||||||||||||.|..|||||||||.|.||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1029 CTTTGACGGGGCCTCAGAGAACAAGTGGACGGCTACCAAAGACTCCGAGGAGAACAAGGAGAATCTGATGCTGA 1102
Query 1106 ATTCTGAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACA 1179
..||.||.|||||.||.|||.||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 1103 GCTCCGAGCTCAAGGATGACATGCTCCTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTCAATGACTCCATCATCTCGGGAACT 1176
Query 1180 CTGCCACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGA 1253
.||||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1177 TTGCCGAGGAAATGCAAGAAGGAGTTGCTGGCAGTGAAGCTGAGGAACCGGCCGAGCAAGCAGGAGCTAGAGGA 1250
Query 1254 CCGGAACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCA 1327
|||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1251 CCGGAACATCTTCCCCAGGAGGACCGATGAGGAGAGACAGGAGATCCGACAGCAGATAGAGATGAAGCTGTCCA 1324
Query 1328 AACGGCTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACA 1401
||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 AAAGGCTGAGCCAGAGACCCGCCGTGGAGGAACTGGAGAGAAGAAATATCCTGAAACAAAGGAATGATCAGACA 1398
Query 1402 GAGCAGGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATT 1475
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GAGCAGGAAGAAAGGAGAGAAATCAAGCAAAGATTAACAAGAAAGCTTAACCAGAGACCCACTGTTGATGAATT 1472
Query 1476 AAGAGACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGG 1549
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473 GAGAGACAGAAAAATTCTGATCCGTTTCAGTGATTATGTGGAAGTAGCAAGAGCACAGGACTATGACAGGAGGG 1546
Query 1550 CAGACAAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGT 1623
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1547 CAGACAAGCCCTGGACAAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAATATAAAAGT 1620
Query 1624 AATGAAATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AACGAAATGGAGGTACACGCATCCAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1674