Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04697
- Subject:
- XM_017027630.1
- Aligned Length:
- 1677
- Identities:
- 1344
- Gaps:
- 333
Alignment
Query 1 ATGGCCGCGTCGGAGGACGGGAGCGGCTGCCTCGTGTCGCGGGGCCGCTCGCAGAGTGACCCCAGCGTCCTCAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGACTCCTCGGCCACCTCCTCCGCGGACGCCGGGGAGAACCCAGATGAGATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC 148
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Sbjct 1 -------------------------------------------------ATGGACCAAACGCCCCCGGCGCGTC 25
Query 149 CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC 222
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Sbjct 26 CTGAATATCTGGTCTCAGGGATTCGAACTCCCCCTGTGAGGAGGAACAGCAAACTGGCCACCCTGGGCAGGATC 99
Query 223 TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 296
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Sbjct 100 TTCAAACCCTGGAAATGGAGGAAAAAGAAAAACGAAAAACTGAAGCAGACAACGTCAGCGCTGGAGAAGAAGAT 173
Query 297 GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA 370
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Sbjct 174 GGCCGGCAGGCAAGGCCGAGAGGAGCTCATCAAGAAGGGGCTGCTGGAGATGATGGAGCAGGATGCTGAAAGCA 247
Query 371 AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT 444
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Sbjct 248 AAACTTGCAACCCCGATGGAGGACCCCGATCTGTACAGAGTGAACCACCCACTCCCAAGTCGGAGACGCTGACT 321
Query 445 TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC 518
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Sbjct 322 TCAGAAGATGCCCAGCCCGGAAGCCCCTTGGCCACTGGGACGGACCAGGTCTCCCTGGACAAGCCACTGTCCTC 395
Query 519 AGCTGCCCACTTGGACGATGCAGCCAAGATGCCTTCTGCATCCAGTGGTGAAGAAGCAGACGCTGGCAGCCTCC 592
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Sbjct 396 AGCTGCCCACTTGGACGATG------------------------------------------------------ 415
Query 593 TGCCCACCACCAATGAGCTCTCCCAAGCCTTAGCTGGGGCTGACTCCCTGGACAGTCCTCCCAGACCTCTGGAG 666
Sbjct 416 -------------------------------------------------------------------------- 415
Query 667 AGATCCGTGGGCCAGCTCCCCAGCCCCCCACTGCTGCCCACTCCGCCACCCAAGGCAAGCTCCAAAACCACAAA 740
Sbjct 416 -------------------------------------------------------------------------- 415
Query 741 AAATGTCACAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC 814
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Sbjct 416 --------CAGGCCAAGCCACACTCTTCCAAGCCTCCAGCATGAAGAGTGCCGACCCTTCCCTCCGGGGCCAGC 481
Query 815 TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG 888
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Sbjct 482 TCTCCACACCCACGGGGTCTCCGCATCTCACCACGGTCCACCGGCCTCTTCCCCCAAGCCGCGTCATTGAGGAG 555
Query 889 CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA 962
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Sbjct 556 CTGCACAGGGCGCTGGCCACGAAGCACCGCCAGGACAGTTTTCAAGGAAGAGAAAGTAAAGGGTCTCCAAAGAA 629
Query 963 GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG 1036
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Sbjct 630 GCGGCTGGATGTCCGTCTGTCGAGAACGTCCAGCGTGGAGCGGGGCAAGGAGAGGGAGGAGGCTTGGAGCTTTG 703
Query 1037 ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT 1110
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Sbjct 704 ACGGGGCATTGGAGAACAAGCGAACTGCCGCTAAGGAATCTGAGGAGAACAAGGAGAACCTGATCATAAATTCT 777
Query 1111 GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC 1184
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Sbjct 778 GAACTCAAAGACGACTTGCTTTTGTATCAGGACGAGGAGGCGCTGAACGACTCCATTATTTCTGGAACACTGCC 851
Query 1185 ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA 1258
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Sbjct 852 ACGGAAATGCAAGAAGGAGCTCCTGGCCGTGAAGCTAAGGAACCGGCCAAGCAAACAGGAACTAGAAGACCGGA 925
Query 1259 ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG 1332
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Sbjct 926 ACATTTTCCCCAGAAGGACTGATGAAGAAAGACAGGAGATCCGGCAGCAGATCGAGATGAAGCTTTCCAAACGG 999
Query 1333 CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA 1406
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Sbjct 1000 CTGAGCCAAAGACCTGCCGTGGAAGAGCTGGAGAGAAGAAATATCTTGAAACAAAGGAATGATCAGACAGAGCA 1073
Query 1407 GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG 1480
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Sbjct 1074 GGAAGAAAGAAGAGAAATCAAGCAAAGATTGACAAGAAAGCTTAATCAGAGACCCACTGTTGATGAATTAAGAG 1147
Query 1481 ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC 1554
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Sbjct 1148 ACAGAAAAATTCTGATACGATTCAGTGATTACGTGGAAGTAGCAAAAGCGCAGGACTATGACAGGAGGGCAGAC 1221
Query 1555 AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA 1628
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Sbjct 1222 AAACCCTGGACGAGACTGTCAGCAGCAGATAAGGCAGCAATTCGTAAAGAATTAAATGAGTACAAAAGTAATGA 1295
Query 1629 AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1677
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Sbjct 1296 AATGGAGGTACATGCATCAAGCAAGCACTTGACAAGATTCCACAGGCCA 1344
