Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04817
- Subject:
- NM_001323911.2
- Aligned Length:
- 1389
- Identities:
- 1174
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT 74
Query 75 GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC 148
Query 149 ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC 222
Query 223 TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC 296
Query 297 CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA 370
Query 371 TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC 444
Query 445 AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCC 518
Query 519 TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTA 592
Query 593 TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACC 666
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCT----------------------------------------------- 619
Query 667 TCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAA 740
|||||||
Sbjct 620 -------------------------------------------------------------------CAGCCAA 626
Query 741 TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 TACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGG 700
Query 815 TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAG 774
Query 889 CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 CCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGT 848
Query 963 AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 AATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGG 922
Query 1037 AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 AGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAA 996
Query 1111 TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACA 1070
Query 1185 GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAG-GTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGG 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||.|....|||||..|||..
Sbjct 1071 GCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGAGT-----CTCTCTCTGTCACCCAGGCT 1139
Query 1258 GAGTTGGAAGAGAG-AGAGACAAAAGTGA--CTGGGTCA--GCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCC 1326
| |||.| ||.|.|| ||| .|||.||| ||| |||.| .|.|||.| |.|||
Sbjct 1140 G--------GAGCGCAGTGGCA----TGATCTTGGCTCATTGCA---ACCTC--TGTCTCCC----GGGTT--- 1189
Query 1327 ATGGCAACTGTTTCATCT--------------------------------------- 1344
|||..|.|||.|||
Sbjct 1190 ----CAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCTGAAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCGC 1242