Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04817
- Subject:
- XM_011240061.2
- Aligned Length:
- 1358
- Identities:
- 1071
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT 74
||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||..|
Sbjct 1 ATGTCTCTGGTGGACTTGGGGAAGAGGCTGCTAGAAGCTGCAAGGAAAGGCCAAGACGATGAAGTGAGGACACT 74
Query 75 GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC 148
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 GATGGCAAATGGGGCTCCATTCACCACAGACTGGCTCGGAACATCACCGCTTCACCTTGCAGCCCAGTATGGTC 148
Query 149 ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC 222
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 149 ATTATTCCACAGCAGAAGTGCTCCTTCGAGCTGGCGTTAGCAGGGATGCCCGGACCAAAGTGGACAGGACCCCT 222
Query 223 TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC 296
|||||.|||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||.||
Sbjct 223 TTGCATATGGCTGCAGCTGATGGACATGTTCACATCGTGGAACTGCTTGTTAGGAGTGGTGCAGATGTGAACGC 296
Query 297 CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA 370
.||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AAAGGACATGCTGCAGATGACAGCTCTGCACTGGGCCACAGAGCACCATCACCGGGATGTCGTCGAGTTACTTA 370
Query 371 TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC 444
||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 371 TCAAATATGGAGCTGATGTCTACGCTTTTAGCAAATTTGATAAGTCTGCCTTTGACATAGCAATGGAGAAAAAC 444
Query 445 AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCA-GAGAGAGCCAACC 517
|||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||...||| ||| |||||||||||||
Sbjct 445 AATACTGAGATTTTGGTCATGCTTCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAACACTAA-CCACGAGAGAGCCAACC 517
Query 518 CTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTT 591
|.|||.||.|||||||||.|.||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||||||||.|||.||
Sbjct 518 CAGTGGCTAACCCTGTGACTGTGACTGCTCCGTTCATCTTCACCTCTGGAGAGGTCATTAACCTCGCTAGCTTT 591
Query 592 ATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCAC 665
.|.||||||.|||||||||||.||||||||| |||| |||
Sbjct 592 GTCTCTTCAGCCAACACCAAAGCAACCTCAG-------------CTCA---------TTT-------------- 629
Query 666 CTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCA 739
Sbjct 630 -------------------------------------------------------------------------- 629
Query 740 ATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGG 813
|||.|||||...||||||||||||..|||||||.||.|.|||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 630 ----AGAAGAAATGGAAGAAGGAAATTCTCTTGACTCCTCGACCCAGCAAGTGGTGGGGAGTGGAGGCCAGAGG 699
Query 814 GTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCA 887
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 700 GTCATCACCATCGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAACATCCAAACATCACTCCCTGCTGGAGGCATTGGCCA 773
Query 888 GCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTG 961
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||..
Sbjct 774 GCCATTTATTGTAACTATGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTGCCTGCTGGTCAGGTTGCAGAGGAGACAA 847
Query 962 TAATTAAAGAGGAA------GAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAAC 1029
|||||.||||.||| |||||||||||.||||||.|....||||.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 848 TAATTGAAGATGAAGAAGAGGAAGAAGAGAAATTGCCATTGGTGAAGAGACCAAGGATGGCAGAGATGACAAAC 921
Query 1030 AGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGC 1103
||.||.|||||||..||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 922 AGGGTTGAGGAAATGAAGGAAGGCAGTGAAAGAGAGCTACTGCAGCAACAGCTCCAGGAGGCCAACCGAAGAGC 995
Query 1104 CCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAG 1177
||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|.|||||||||.||.|
Sbjct 996 CCAGGAGTACAGACACCAGCTCCTCAAGAAAGAGCAGGAGGCCGAGCAGTATCGGCTCAGGCTGGAGGCTATGG 1069
Query 1178 CCCGACAGCAGCCCAA------TGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTA 1245
|.|..||||||.|||| ||.|||||||.|||||.|.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1070 CTCAGCAGCAGACCAACGGAGTTGAAGTTGATGTCACCGTAGTTGAGGAAGTAGCTGAAGTGGATGCTGTAGTG 1143
Query 1246 GTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTG-GGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTA 1318
||.|||||.|||||...||.|||.||||..|||.||||.| || .|||||.|.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1144 GTGACAGAAGGGGACGAGGTAGAAAGAGCAACACAAGTCA-TGAAGTCAGGAAGGACCACGGAGCCTCACACTA 1216
Query 1319 GAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT 1344
..||||||||.|.||||.|||||||.
Sbjct 1217 ACGTTTCCATAGAAACTATTTCATCC 1242