Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04817
• Subject: XM_017000250.2
• Aligned Length: 1392
• Identities: 1230
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTG-----------------------------------------  107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGTTTTCCAAATTGAGAGTCTCCTGTGGATATATAGGTGATA  148

Query  108  -------GCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT  174
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTGTAAGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT  222

Query  175  CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA  296

Query  249  TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT  370

Query  323  TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT  444

Query  397  TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA  518

Query  471  GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG  592

Query  545  CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC  666

Query  619  TCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACCTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCT  692
            |                                                                         
Sbjct  667  T-------------------------------------------------------------------------  667

Query  693  TGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT  766
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  -----------------------------------------CAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT  700

Query  767  CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC  774

Query  841  CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG  848

Query  915  ACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGTAATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGT  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  ACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGTAATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGT  922

Query  989  TGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  TGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGA  996

Query 1063  GAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGA  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  GAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGA  1070

Query 1137  GCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACAGCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCA  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  GCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACAGCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCA  1144

Query 1211  TGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  TGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTG  1218

Query 1285  ACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT  1344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  ACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT  1278