Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04817
• Subject: XM_017000253.2
• Aligned Length: 1392
• Identities: 927
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTG-----------------------------------------  107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGTTTTCCAAATTGAGAGTCTCCTGTGGATATATAGGTGATA  148

Query  108  -------GCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT  174
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTGTAAGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTCATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTT  222

Query  175  CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCCTTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACA  296

Query  249  TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGCCAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTT  370

Query  323  TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTATCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCT  444

Query  397  TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAACAATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCA  518

Query  471  GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCAGAGAGAGCCAACCCTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTG  592

Query  545  CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTTATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACC  666

Query  619  TCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACCTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCT  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCACCTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCT  740

Query  693  TGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCAATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATT  814

Query  767  CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGGGTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTC  888

Query  841  CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCAGCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGG  962

Query  915  ACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTGTAATTAAAGAGGAAGAAGAAGAGAAGT  988
            ||||||||              |..||.||                                            
Sbjct  963  ACAGCAAG--------------GAAGGCAA--------------------------------------------  978

Query  989  TGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAACAGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGA  1062
                                                                                      
Sbjct  979  --------------------------------------------------------------------------  978

Query 1063  GAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGCCCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGA  1136
                                                                                      
Sbjct  979  --------------------------------------------------------------------------  978

Query 1137  GCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAGCCCGACAGCAGCCCAATGGAGTTGATTTCACCA  1210
                                                                                      
Sbjct  979  --------------------------------------------------------------------------  978

Query 1211  TGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTAGTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTG  1284
                                                                                      
Sbjct  979  --------------------------------------------------------------------------  978

Query 1285  ACTGGGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTAGAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT  1344
                                                                        
Sbjct  979  ------------------------------------------------------------  978