Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04817
• Subject: XM_017319515.1
• Aligned Length: 1358
• Identities: 902
• Gaps: 316

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGGTGGACTTGGGAAAGAGGTTGCTAGAAGCAGCAAGAAAAGGCCAAGATGATGAAGTGAGAACGTT  74
            ||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||..|
Sbjct    1  ATGTCTCTGGTGGACTTGGGGAAGAGGCTGCTAGAAGCTGCAAGGAAAGGCCAAGACGATGAAGTGAGGACACT  74

Query   75  GATGGCAAATGGCGCCCCATTCACCACAGACTGGCTTGGAACATCACCCCTCCACCTTGCAGCTCAATATGGTC  148
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GATGGCAAATGGGGCTCCATTCACCACAGACTGGCTCGGAACATCACCGCTTCACCTTGCAGCCCAGTATGGTC  148

Query  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTACTCCTTCGAGCAGGTGTTAGCAGGGATGCCCGGACTAAAGTAGACAGGACCCCC  222
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  ATTATTCCACAGCAGAAGTGCTCCTTCGAGCTGGCGTTAGCAGGGATGCCCGGACCAAAGTGGACAGGACCCCT  222

Query  223  TTGCACATGGCTGCAGCCGATGGACATGCGCACATCGTGGAACTGCTTGTTCGGAATGGTGCAGATGTGAATGC  296
            |||||.|||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGCATATGGCTGCAGCTGATGGACATGTTCACATCGTGGAACTGCTTGTTAGGAGTGGTGCAGATGTGAACGC  296

Query  297  CAAGGACATGCTGAAGATGACAGCTTTGCATTGGGCCACAGAGCGCCACCATCGAGATGTCGTAGAGTTACTTA  370
            .||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AAAGGACATGCTGCAGATGACAGCTCTGCACTGGGCCACAGAGCACCATCACCGGGATGTCGTCGAGTTACTTA  370

Query  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCCATGCTTTCAGCAAATTTGATAAATCAGCCTTTGACATAGCTCTGGAGAAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  371  TCAAATATGGAGCTGATGTCTACGCTTTTAGCAAATTTGATAAGTCTGCCTTTGACATAGCAATGGAGAAAAAC  444

Query  445  AATGCTGAGATTTTGGTCATCCTCCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAATGTTAATCCA-GAGAGAGCCAACC  517
            |||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||...||| ||| |||||||||||||
Sbjct  445  AATACTGAGATTTTGGTCATGCTTCAGGAAGCAATGCAGAATCAGGTGAACACTAA-CCACGAGAGAGCCAACC  517

Query  518  CTGTGACTGACCCTGTGAGTATGGCTGCTCCATTCATCTTCACGTCGGGTGAGGTTGTTAACCTCGCAAGCCTT  591
            |.|||.||.|||||||||.|.||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||||||||.|||.||
Sbjct  518  CAGTGGCTAACCCTGTGACTGTGACTGCTCCGTTCATCTTCACCTCTGGAGAGGTCATTAACCTCGCTAGCTTT  591

Query  592  ATTTCTTCAACCAACACCAAAACAACCTCAGGTGACCCCCATGCCTCAACAGTACAGTTTTCAAATTCTACCAC  665
            .|.||||||.|||||||||||.|||||||                                             
Sbjct  592  GTCTCTTCAGCCAACACCAAAGCAACCTC---------------------------------------------  620

Query  666  CTCAGTGCTGGCTACCCTTGCAGCTCTTGCTGAGGCATCAGTCCCCCTCTCCAACTCACACAGAGCCACAGCCA  739
                                                                                      
Sbjct  621  --------------------------------------------------------------------------  620

Query  740  ATACAGAGGAAATTATAGAAGGAAATTCCGTTGACTCATCAATCCAGCAAGTAATGGGGAGTGGAGGCCAGAGG  813
                                                                                      
Sbjct  621  --------------------------------------------------------------------------  620

Query  814  GTCATCACCATAGTGACTGATGGAGTCCCTCTGGGTAATATCCAAACTTCAATCCCTACTGGAGGCATTGGCCA  887
                                                                                      
Sbjct  621  --------------------------------------------------------------------------  620

Query  888  GCCATTTATTGTAACTGTGCAAGATGGACAGCAAGTTCTAACTGTACCTGCTGGTAAGGTTGCAGAGGAGACTG  961
                                             ||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||..
Sbjct  621  ---------------------------------AGTTCTAACTGTGCCTGCTGGTCAGGTTGCAGAGGAGACAA  661

Query  962  TAATTAAAGAGGAA------GAAGAAGAGAAGTTGCCACTAACAAAGAAACCAAGGATAGGAGAGAAGACAAAC  1029
            |||||.||||.|||      |||||||||||.||||||.|....||||.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  662  TAATTGAAGATGAAGAAGAGGAAGAAGAGAAATTGCCATTGGTGAAGAGACCAAGGATGGCAGAGATGACAAAC  735

Query 1030  AGTGTGGAGGAAAGCAAGGAAGGCAATGAAAGAGAGCTACTACAGCAACAACTCCAGGAGGCCAATCGAAGAGC  1103
            ||.||.|||||||..||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  736  AGGGTTGAGGAAATGAAGGAAGGCAGTGAAAGAGAGCTACTGCAGCAACAGCTCCAGGAGGCCAACCGAAGAGC  809

Query 1104  CCAGGAATACCGACACCAGCTCCTAAAGAAAGAGCAGGAAGCAGAACAGTACCGTCTTAAGCTGGAGGCCATAG  1177
            ||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|.|||||||||.||.|
Sbjct  810  CCAGGAGTACAGACACCAGCTCCTCAAGAAAGAGCAGGAGGCCGAGCAGTATCGGCTCAGGCTGGAGGCTATGG  883

Query 1178  CCCGACAGCAGCCCAA------TGGAGTTGATTTCACCATGGTTGAAGAGGTGGCTGAGGTAGATGCTGTAGTA  1245
            |.|..||||||.||||      ||.|||||||.|||||.|.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct  884  CTCAGCAGCAGACCAACGGAGTTGAAGTTGATGTCACCGTAGTTGAGGAAGTAGCTGAAGTGGATGCTGTAGTG  957

Query 1246  GTCACAGAGGGGGAGTTGGAAGAGAGAGAGACAAAAGTGACTG-GGTCAGCAGGGACCACAGAGCCTCACACTA  1318
            ||.|||||.|||||...||.|||.||||..|||.||||.| || .|||||.|.|||||||.|||||||||||||
Sbjct  958  GTGACAGAAGGGGACGAGGTAGAAAGAGCAACACAAGTCA-TGAAGTCAGGAAGGACCACGGAGCCTCACACTA  1030

Query 1319  GAGTTTCCATGGCAACTGTTTCATCT  1344
            ..||||||||.|.||||.|||||||.
Sbjct 1031  ACGTTTCCATAGAAACTATTTCATCC  1056